施工合同备案的不是不得留合同，可以留存合同为本。法律对于建设工程合同的备案有具体的规定，《房屋建筑和市政基础设施工程施工招标投标管理办法》第47条规定：“订立书面合同7日内，中标人应当将合同送工程所在地的县级以上地方人民政府建设行政主管部门备案。”由此可知建设工程合同的备案是有期限的，要在7日内到指定的部门备案。备案的流程包括以下几项：
1、网上申报。上首先承包人登陆政府门户网站，然后在建设工程合同备案管理信息系统进行合同备案网上申报，根据合同的具体性质、内容在对应的合同备案表中填写相关信息，打印出带条型码的合同备案表。
2、办理备案手续。合同当事人携带相关资料到合同备案管理机构办理合同备案手续。
3、正式签发合同备案表。备案机构审核合同当事人提供的合同备案资料，符合要求的，加盖合同备案专用章。
如果建造合同的结果能够可靠估计，收入确定按完工百分比法。营业税按营业收入款项或者取得索取营业收入款项凭据的当天。已签订书面合同的，为书面合同确定的付款日期的当天;未签订书面合同或者书面合同未确定付款日期的，为应税行为完成的当天。施工企业应设置“工程施工”、“工程结算”两个成本科目。
二、施工合同签订的程序是什么?
建筑施工合同作为合同的一种，其签订也分为要约和承诺两个阶段，发包人通过招标方式选择施工单位，中标通知书发出后，中标人应当与发包人及时签订施工合同，对双方的责任、义务、权益等合同内容进一步协商。
承包人与发包人订立建筑工程施工合同应符合下列程序:
(1)接受中标通知书;
(2)组成包括项目经理的谈判小组;
(3)草拟合同专用条件;
(4)谈判;
(5)参照发包人拟定的合同条件或建筑工程施工合同示范文本与发包人订立建筑工程施工合同;
在我们的日常生活当中，现在如果存在建设工程施工合同的话，那么必须要在规定的时间内完成合同的备案手续，只有这样才能够最终的完成合同，但是双方当事人也是可以留存合同文本的。
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