签订的合同与备案的合同一致的，可以认定为合同有效，如果签订的合同和备案合同不一致的，以备案合同为准。当事人就同一建设工程另行订立的建设工程施工合同与经过备案的中标合同实质性内容不一致的，应当以备案的中标合同作为结算工程价款的根据。
二、备案合同变更需要什么手续
变更备案相关证明文件：
(1)凡涉及继承的，须提供公证部门出具的继承公证书;
(2)凡涉及协议离婚的，须提供民政部门的离婚协议书;
(3)凡司法机关出具的法律文书，须同时提供生效证明书或协助执行通知书;
申请人身份证明：
(1)属个人的，提供身份证明复印件;
(2)属企业的，提供工商营业执照复印件、法定代表人或负责人身份证明书复印件、工商企业查询资料正本;
(3)属国家机关、事业单位或社团组织的，提供机构代码证或政府批准成立的文件复印件、法定代表人或负责人身份证明复印件;属企业非法人单位须上级主管部门加意见;
(4)申请人为未成年人的，需由其监护人(父母双方)代签名，提供监护人的身份证明复印件、户口簿或关系证明等相关资料及保证书(监护人);
(5)个人授权他人代理的，须提供经公证或认证的授权委托书原件、委托代理人个人身份证明复印件;
(6)非个人授权他人代理的，须提供法定代表人或负责人签发并加盖公章的授权委托书原件、委托代理人身份证明复印件;
(7)境外个人、企业或组织(包括港澳台地区)提交的身份证明按规定均须经过公证或认证，并提供中文译本;
合同变更
合同变更指有效成立的合同在尚未履行或未履行完毕之前，由于一定法律事实的出现而使合同内容发生改变。
程序规定
(1)变更合同也应贯彻协商的原则。
当事人一方应向对方提出变更合同的要约(先做出意思表示);对方对要约的承诺与否(是否完全同意要约的内容);双方在没有达成新的协议之前，单方面变更合同属违约行为。
(2)变更合同的协议最好采用书面形式。
新的协议未达成之前，原合同仍然有效(变更解除的电报、图表、书信等也应作为资料保管)。
综上所述，签订的合同与备案的合同一致的，可以认定为合同有效，如果签订的合同和备案合同不一致的，以备案合同为准。而且，施工合同签订以后必须要在一定时间内到相关的管理部门备案的。
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