1、网上申报。上首先承包人登陆政府门户网站，然后在建设工程合同备案管理信息系统进行合同备案网上申报，根据合同的具体性质、内容在对应的合同备案表中填写相关信息，打印出带条型码的合同备案表。
2、办理备案手续。合同当事人携带相关资料到合同备案管理机构办理合同备案手续。
3、正式签发合同备案表。备案机构审核合同当事人提供的合同备案资料，符合要求的，加盖合同备案专用章。
法律对于建设工程合同的备案有具体的规定，《房屋建筑和市政基础设施工程施工招标投标管理办法》第47条规定：“订立书面合同7日内，中标人应当将合同送工程所在地的县级以上地方人民政府建设行政主管部门备案。”由此可知建设工程合同的备案是有期限的，要在7日内到指定的部门备案。
《房屋建筑和市政基础设施工程施工招标投标管理办法》第四十七条规定，对于经过招投标程序的建设工程施工合同，其在自投标人中标时就已成立。法律并未规定需经登记备案才生效。
这条规定是国家政府管理部门为了严格管理和监督建设工程合同而采取的行政管理方法。
设立这种备案制度，并不是中标合同必须经过行政部门审查批准才生效，而是确定以经过备案的中标合同作为承包人与发包人双方之间结算工程款的依据。
因此自合同中标时即成立并生效，双方均享有合同权利，应依法履行合同义务。如发包公司违反合同约定将工程擅自再发包给其他建筑公司，属违约行为，应依法承担相关违约责任。
上文中提到的这些内容就是建筑施工合同备案的主要流程，施工合同是否备案并不影响合同的法律效力，合同备案也不是效力性的强制规定。但是就合同标的发生纠纷时，不能按照此合同的条款解决问题。备案合同中的标的是承包人与发包人双方之间结算工程款的依据。
延伸阅读：
建设工程施工合同纠纷司法解释
为正确审理建设工程施工合同纠纷案件，依...
工程施工合同有哪些内容?
工程施工合同的主要内容包括以下几项：1、...
建设工程施工合同范本是怎样的？
内容包括：发包人，承包人，工程名称，工程...
怎样解除工程施工合同
建筑防水工程施工合同的范本是怎...
1、首先写明建设单位与施工单位信息。2、...
最新建筑施工合同范本完整版
最新建筑施工合同范本完整版要写发包人(全...
