工程款结算的原则：按合同约定的计价标准或计价方法结算。尊重合同当事人的约定，充分体现了合同法中的意思自治原则。因工程量或质量标准发生变化，当事人对该部分工程价款不能协商一致的，可以参照签订合同时当地建设主管行政部门发布的计价标准或计价方法结算，但施工合同有效而工程竣工验收不合格的，若经修复
仍竣工验收不合格的，承包人请求支付工程款，法院不予支持。2施工合同无效，工程竣工验收合格，仍可以参照合同约定结算。
实践中，合同约定涉及的原则：
1、价格标准，约定采用定额，还是清单方法;
2、工程量核定及调整的约定，特别是各种变更情况下的工程量调整原则;
3、关于签证的原则，怎样才是有效的签证，其形式和内容的要件的约定，以及有效授权的要件，约定明确的管理流程。
工程进度款是指在施工过程中，按逐月或其他标准完成的工程数量计算的各项费用总和。
工程结算是指施工企业按照承包合同和已完工程量向建设单位办理工程价清算的经济文件。工程建设周期长，耗用资金数大，为使建筑安装企业在施工中耗用的资金及时得到补偿，需要对工程价款进行中间结算、年终结算，全部工程竣工验收后应进行竣工结算。 全名为工程价款的结算，是指施工单位与建设单位之间根据双方签订的合同所进行的工程合同价款结算，也就是工程完工后最后支付给承包商的工程款。
所以，通过以上的概念界定可以看出，工程进度款和工程结算款最大的区别在于支付的时间不同，工程进度款发生在施工过程中，而工程结算款发生在施工完成后，在进行工程结算款时需要扣除已经支付的工程进度款。
1、按月定期结算。按月定期结算是指每月由施工企业提出已完成工程月报表，连同工程价款结算账单，经建设单位签证，交建设银行办理工程价款结算的方法。
2、分段结算。分段结算是指以单项工程为对象，按施正形象进度将其划分为不同施工阶段，按阶段进行工程价款结算。 分阶段结算的一般方法是根据工程的性质和特点，将其施工过程划分为若干施工进度阶段，以审定的施工图预算为基础，测算每个阶段的预支款数额。在施工开始时，办理第一阶段的预支款，在该阶段完成后，计算其工程价款，经建设单位签证，交建设银行审查并办理阶段结算，同时办理下一阶段的预支款。
3、竣工后一次结算。竣工后一次结算是指建设项目或单项工程全部建筑安装工程建设期在一年以内，或者工程承包合同价值在100万元以下的，可以实行工程价款每月预支或分阶段预支，竣工后一次结算工程价款的方式。
