1、合同的有效性问题，一些建筑工程诉讼中，工程款的取得首先要解决合同的有效性问题，由于目前建筑市场中普遍存在挂靠、借用资质的现象，因此这些都会导致施工合同的无效，还有就是是否存在转包、违法分包的情况，这些都会导致合同本身的无效，但是即使存在合同无效，如果建设单位没有提出合同无效的抗辩或者工程质量合格，你还是可以参照施工合同取得工程价款。
2、合同的相对行问题，由于目前挂靠、借用资质以及转包情况较多，如果你们要提出工程款请求，必须和业主存在直接的合同关系或者有有效的授权委托，否则业主有权拒绝付款。
3、工程结算方式及数额的问题，工程款结算是施工企业工程款清欠的核心环节，也是发承包双方的争议焦点。施工合同价款确定有三种方式，即固定价格合同、可调价格合同和成本加酬金合同。不知道你们的合同属于何种情况，根据我的经验，目前较多使用的是采用可调价格合同。如果是这类合同，就存在工程结算数额特别是工程洽商变更确定的问题，如果双方对于工程结算已经有文件则按照该文件执行，如果存在争议则可申请司法鉴定，按照鉴定结果给付款项。
