双方当事人达成和解协议的，法院会以终结执行的方式结案;如果已经对和解执行履行完毕，法院会以执行完毕的方式结案。
生效法律文书确定的执行内容，经被执行人自动履行、人民法院强制执行，已全部执行完毕，或者是当事人达成执行和解协议，且执行和解协议履行完毕，可以以“执行完毕”方式结案。
执行完毕应当制作结案通知书并发送当事人。双方当事人书面认可执行完毕或口头认可执行完毕并记入笔录的，无需制作结案通知书。
执行和解协议应当附卷，没有签订书面执行和解协议的，应当将口头和解协议的内容作成笔录，经当事人签字后附卷。
和解协议的内容必须符合法律和行政法规的规定。尽管执行和解是当事人在执行程序中自行协商达成协议解决争议的活动，但因涉及到双方诉讼权利和实体权利的处分，所以必须以合法为前提。也就是说，和解协议的内容不能违反法律的规定，不得损害国家利益、公共利益及其它公民、法人的合法权益，不能以此规避法定义务。否则，即使双方当事人出自真实自愿，亦属无效。
二、法院调解协议结案后必须撤诉吗?
签了法院的调解书后，即发生了法律效力，是不需要撤诉的。调解协议或者调解书经双方当事人签收后，就具有法律效力，其效力与判决相同，具体表现在以下几方面：
1.诉讼结束，当事人不得以同一事实和理由再行起诉。
2.一审的调解协议或调解书发生效力后，当事人不得上诉。
3.当事人在诉讼中争议的法律关系中的争议归于消灭，当事人之间实体上的权利义务关系依调解协议的内容予以确定。
4.具有给付内容的调解书，具有强制执行力。当负有履行调解书义务的一方当事人未按调解书履行义务时，权利人可以根据调解书向人民法院申请强制执行。
综上所述，既然和解了，协商执行费分担也就不是难事。申请执行人撤案，就结案了。当然要缴纳执行费，因为这是国家规定的必须要缴纳的一项费用，如果国家规定不需要缴纳的话当然不会收取，既然在法院立了案，即使是双方私下达成和解，那么该收的还是要收。
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