二者相区分的关键在于其犯罪的客观方面、犯罪主体不同：妨害公务罪通常必须是以暴力、威胁方法实施，且行为人侵害公务人员的行为必须发生在后者依法执行公务期间，而拒不执行判决、裁定罪则不要求必须使用暴力、威胁的方法，可以是能够损害法院裁判约束力、权威性的任何方法，比如欺骗隐瞒、无理取闹等等;而且，拒不执行判决、裁定罪也不要求必须发生在人民法院依法执行职务期间;妨害公务罪的主体是一般主体，而拒不执行判决、裁定罪的主体则是特殊主体，即必须具有执行判决、裁定义务的当事人或者依照法律对判决、裁定负有协助执行义务的人。
首先妨害公务罪的犯罪对象是依法执行职务的国家工作人员。妨害公务罪的犯罪对象是生效的判决、裁定。其次妨害公务罪的犯罪手段必须是暴力、威胁，这是宪法规定的犯罪所不具备的。一般认为，对执行人使用暴力的目的是阻碍判决、裁定的执行。因此对拒不执行判决、裁定的人定罪比较合适。
二、法院判决书下来后不执行怎么办?
1、判决书生效之后，需要当事人向作出生效判决的法官开出案件生效证明书，然后持生效证明书到法院执行部门立案，才能执行。法官很少直接将生效判决转到执行部门的，除非是涉及公共利益的生效判决。
发生法律效力的民事判决、裁定，当事人必须履行。一方拒绝履行的，对方当事人可以向人民法院申请执行，也可以由审判员移送执行员执行。
2、判决生效后，当事人需要在2年内向执行法院申请执行。如果当事人在2年后申请执行，执行法院仍然会立案执行，不过如果被执行人提出执行时效异议的，法院将停止执行。
3、法院执行局的案件特别多，法官特别忙，当事人最好能提供线索，协助法官会执行的更快。另外建议：法官也不是万能的，他们真的太忙。不要等，要多去找法官了解进展，多跟执行法官沟通，想方设法获取案件线索交给法官，才能得到更好的执行。
这两种罪名的法律概念不同，所产生的后果不同，判决书下达之后，必须按照判决书的规定履行义务，如果一方拒绝履行义务，对方可以向人民法院申请执行，申请执行的期限是两年。对于一审判决书来说，并不是判决书下达之后就产生法律效力，还有一定的上诉期。
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