南京土地使用费标准包含的项目有：新增建设用地有偿使用费;土地管理费;土地出让金;耕地开垦费;土地登记费;土地使用证工本费;土地租金等。土地使用者因使用土地而向土地所有者支付的费用，是土地使用者获得用地应付出的代价。
(一)新增建设用地有偿使用费：每平方米14元。依据财综[2009]24号
(二)土地管理费：使用土地每平方米0.4元;征用土地，不超过征地总额的3%。依据鲁价发[2001]30号文件规定。
(三)土地出让金：根据不同情况分别收取不低于评价估地价的20%、40%、80%的土地出让金。依据鲁国土资发[2000]252号文件规定。
(四)耕地开垦费：占用基本农田的按前三年平均年产值的10—12倍收取(每亩10000—12000元);占用一般耕地的按前三年平均产值的8—10倍收取(每亩8000—10000元)。依据《土地管理法》第三十一条、《山东省实施<土地管理法>办法》第十六条规定。
(五)土地登记费：1000平方米以下100元，每超过500平方米加收40元。依据[1995]鲁土籍字第11号文件规定。
(六)土地使用证工本费：精装本每本20元，简装本每本10元。依据计价格[2001]1734号文件规定。
(七)土地租金：划拨土地补办租赁手续，根据用地性质和土地等级按每平方米1.04—6.59元收取;划拨土地使用权出租，按照用地性质，以租赁合同额的15—25%的标准收取;出让土地改变用途的，按照实际用途的土地纯收益之差收取租金。依据《土地管理法》、《山东省国有土地租赁办法》、泗政办发[2001]50号文件及县长令规定。
南京市对于土地使用费的收费是有着一定的标准的，通常需要收取七种费用作为使用土地需要付出的代价，每一项的收费都有着自己的计算方式和标准，如果收费的标准有改变的，会在有关部门或者官网上进行更新通知，土地使用者需要严格遵守。
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