农村土地使用权变更登记也是到县级以上人民政府的土地行政主管部门办理的，就是原来的集体土地使用证在哪里办理的，变更登记也是归该部门所管辖的。只不过，每个人要对集体土地使用证变更的原因都是不一样的，有些是因为继承，有些是因为赠与，所以准备的材料因人而异。
依法改变土地所有权、使用权的，因依法转让地上建筑物、构筑物等附着物导致土地使用权转移的，必须向土地所在地的县级以上人民政府土地行政主管部门提出土地变更登记申请，由原土地登记机关依法进行土地所有权、使用权变更登记。土地所有权、使用权的变更，自变更登记之日起生效。依法改变土地用途的，必须持批准文件，向土地所在地的县级以上人民政府土地行政主管部门提出土地变更登记申请，由原土地登记机关依法进行变更登记。
申请人可以向直接向当地国土资源局不动产登记中心申请宅基地使用权转移登记。办理因继承取得不动产申请登记的，申请人可以提交经公证的材料或生效法律文书。申请人没有上述材料的，应先由全部法定继承人共同到当地不动产登记中心进行继承材料查验，并提交所有继承人的身份证明、被继承人的死亡证明、所有继承人与被继承人的亲属关系证明(户口簿等)、被继承人的土地使用权证书，如果有遗嘱或夫妻财产约定的，也应提交。
二、如何办理集体土地使用证?
1、提出申请
由农村村民个人向所属乡镇国土资源管理所提出申请，领取土地登记申请审批表。提交个人身份证或农村居民户口簿复印件一份。
2、调查
由乡镇国土资源管理所对申请者的用地进行地籍调查、地籍测量、申请人现场指界、邻宗地签字盖章，填写地籍调查表，绘制宗地草图。
3、审核
先由乡镇国土资源管理所进行审核，再报县国土资源局审核，审核用地材料是否合法，用地界线是否无争议，用地面积是否准确。
4、审批
经审核符合“用地面积清楚，界址准确，权属合法，无争议”原则的，可批准并进行张榜公布，在公布一个月内无单位或个人对其提出争议的，由县人民政府颁发集体土地使用证。
综上所述，我国的土地在法律规定上一般是不支持宅基地的买卖的，但是村民之间有相应的关联的，那么是可以进行宅基地的买卖的，土地使用证都是由相关的国土资源部门来进行管理的，在办理变更登记的时候到相关部门就可以了。
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