土地转让协议违约金由转让人和受让人协商确定，协商时约定违约金的具体数额，在转让协议中载明。
《中华人民共和国民法典》
第五百八十五条 【违约金】当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。
约定的违约金低于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以增加;约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。
当事人就迟延履行约定违约金的，违约方支付违约金后，还应当履行债务。
二、土地转让的方式
土地转让有两种方式：一是土地所有人将土地所有权有偿或无偿地转移给他人，二是在土地家庭承包经营的情况下，土地转让指承包人自找对象，由第三者代替自己向发包人履行承包合同的行为。
1、土地所有人将土地所有权有偿或无偿地转移给他人。有偿的是买卖，无偿的是赠与或遗赠。土地转让行为只能发生在土地私有制的社会里，我国在农业、手工业和资本.主义工商业社会主义改造基本完成之后，土地变私有制为公有制，因而不允许土地转让。但是土地的使用权可以依法转让，受让人仅对土地享有使用权，而所有权仍属于国家或集体。
2、在土地家庭承包经营的情况下，土地转让指承包人自找对象，由第三者代替自己向发包人履行承包合同的行为。转让的合同内容虽无改变，但是变更了承包人，终结了原承包人与发包人的权利义务关系，确立了受让人与发包人的权利义务关系。土地承包经营权转让时，承包方与第三者应订立书面协议。
土地买卖转让合同违约金可以由双方协商处理约定，如果处理不好的就可以向法院起诉解决，一方不履行合同的条款，或者是履行了合同的条款但不符合规定，那么同样是需要承担违约责任。
在我们的日常生活中，如果是需要签订民事合同的话，需要注意的是，合同违约是需要支付一笔违约金的，但对于此违约金的金额需要由双方来进行协商确定，只要不过份高于法律所规定的比例，那么就可以保障到双方的合法权益，如果高于此例是可以要求降低的，这都是有法律依据的。
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