1、因为证件不全可以补办手续的建筑，这样的建筑不能认定为违章建筑
《城乡规划法》中有这样的规定，可以通过补办相关手续来获得房屋建设的许可证，所以说对于可以补办手续的违法建筑应当是予以限期改正的机会。
2、只有土地使用权没有房产证的房子，不应当被认定为违法建筑
如果自己的房屋只有土地使用权证，没有房产证和相应的建筑工程规划手续，那么是不能被认定为违法建筑的，这种情况属于证件不全，到最后还是可以补办的。
3、行政机关同意招商引资企业建设的建筑
企业会经过行政机关或者职能部门同意建设建筑，那么这些被同意的建筑其实也应该不被算作违反建筑。
4、从行政机关直接买断土地使用权的，并且在该土地上建造的建筑物
有的人会通过招商引标或者拍卖的方式，通过行政机关来购买土地使用权，但如果当时出售的只有地上土地的使用权而没有地上房屋的相关手续，这样的建筑到最后是不会被认定为违章建筑的。
农村在承包地或者荒山荒地自由开垦的土地，基本农田建设的土地，这三类土地上的建筑不应当被认定为违法的建筑。
6、在土地总体规划之前建造的房屋
这样的房屋符合当时的土地规划，那么建造之后虽然不符合现在的土地建设条件，不过也不能随便的就被认定为是违章建筑，按照法律规定来看只能没收，不能限期来拆除。
二、强拆要通过什么申请
从《中华人民共和国土地管理法实施条例》《最高人民法院关于审理涉及农村集体土地行政案件若干问题的规定》《国有土地上房屋征收与补偿条例》等法律、法规规定中不难看出，无论是征收集体土地还是国有土地上的房屋，行政机关若要实现强制搬迁和拆除，必须按照法定程序申请人民法院强制执行。在获得法院的准许强制执行裁定前，即便被征收人已经得到补偿安置或者无正当理由不接受补偿安置，征收机关也无直接拆除被征收房屋的权力。
一个是因为证件不齐全，那么有关部门是不能进行强行的拆除，或者是行政机关买断土地以及招商之类的也是不能够强拆的。如果暴力强拆可能会有一定的法律责罚比如故意伤害罪、故意杀人罪等。
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