无证房屋在拆迁时补偿不会低于有证房屋的，对无证房屋一概不给予补偿是拆迁方损害被拆人合法权益的做法，拆迁方还是要考虑具体情况，不能草率的下判断。自家房屋如果目前缺失权属证明，我们也应当尽快去有关部门查看能不能补办相关的手续。
法律规定对于无证房屋并没有如一些拆迁方所言就一定是违建，在作出房屋征收决定之前拆迁方要对拆迁区域涉及的房屋进行调查，要考虑房屋建造的年代、建造时的相关规定以及是否存在相关部门不作为等因素来综合确定相应的安置补偿方案。很常见一种是因为历史遗留的原因，房屋建造的伊始是符合法律相关规定的，虽然没有合法的权属证明，但是应当符合拆迁安置补偿的标准，不应该被区别对待。
无证建筑不一定就是违章建筑，拆迁方应得对具体情况具体分析，即使被认定为违章建筑，除特殊情况，也应当给予适当的补偿。那为什么还是有很多无证建筑被认定为违建不予补偿呢?把无证建筑认定为违章建筑可以压缩拆迁成本，也能尽快使拆迁协议达成，加速项目进度，但是这严重地损害了被拆迁人的合法权益。但是如果房屋严重违反城乡规划法及土地管理法的相关规定，就比如听到拆迁消息恶意抢建的房屋则不予补偿是符合法律规定的。
二、法律依据：
参照《国有土地上房屋征收与补偿条例》第二十四条规定我们来看：“市、县级人民政府作出房屋征收决定前，应当组织有关部门依法对征收范围内未经登记的建筑进行调查、认定和处理。对认定为合法建筑和未超过批准期限的临时建筑的，应当给予补偿;对认定为违法建筑和超过批准期限的临时建筑的，不予补偿。”
拆迁时，如果发现自己的房屋是无证房屋，也不要怕，并不会像拆迁方吓你的那样没有一分钱补偿，可以依据法律规定维护自己的权益。
在日常生活当中，我们如果房屋被政府征收过去来用作一些公共建设的用途，那么此时会得到一定的补偿，而且这种补偿的话是不能够有差异的对待的，必须是所有的公民对待所有的房屋情况都是统一的标准，这样才能够公平公正的。
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