房屋转让个人所得税可以向税务机关申请，也可以通过APP直接办理。对于纳税人因为平时扣除不足或未申请扣除等原因导致多预缴了税款，无论收入高低，无论退税额多少，纳税人都可以申请退税。即年度综合所得年收入额不足6万元，但平时预缴过个人所得税的。
根据《中华人民共和国税收征收管理法》第五十一条 纳税人超过应纳税额缴纳的税款，税务机关发现后应当立即退还;纳税人自结算缴纳税款之日起三年内发现的，可以向税务机关要求退还多缴的税款并加算银行同期存款利息，税务机关及时查实后应当立即退还;涉及从国库中退库的，依照法律、行政法规有关国库管理的规定退还。
二、具体的退税流程是什么?
1、下个人所得税APP，注册账号，登陆账号。个人所得税APP非常智能，注册好之后，在个人中心完善个人信息，并添加银行卡，这张银行卡就是税款将要退回的地方。
2、查询年度的纳税明细。可以在首页的“收入纳税明细查询”一栏中查询，里面有年度和每个月的的收入金额和已申报税额。
3、在办税界面-税费申报-综合所得汇算申报处进行申报。默认的是简易申报，系统已经自动计算出退税金额。如果需要调整申报数额，可以切换到“标准申报”进行办理。确认提交后就可以申请退税啦。
4、税务部门审查。在服务界面-申报信息查询中，点击申报查询可以查看退税的进度。
需要注意的是，为方便纳税人获取退税，纳税人年度综合所得收入额不超过6万元且已预缴个人所得税的，税务机关在网上税务局(包括手机个人所得税APP)提供便捷退税功能，纳税人可以通过简易申报表办理年度汇算退税。
对于房屋转让时交纳的个人所得税超过了应缴的税额的，那么是可以获得退税处理的，具体情况下可以由当事人按照上述规定的程序来进行办理，如果对相关情况的处理不清楚的，可以向税务部门的工作人员咨询了解。
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