个人所得税专项扣除申报晚了可以退税，可以申请退个人所得税的具体情形是：
1、上年度综合所得收入额不足6万元，但平时预缴过个人所得税的。
2、上年度有符合条件的专项附加扣除，但预缴税款时没有申报的。
3、因年中就业、退职或者部分月份没有收入等原因，减除费用6万元、“三险一金”等专项扣除、子女教育等专项附加扣除、企业(职业)年金以及商业健康保险、税收递延型养老保险等其他扣除不充分的。
4、没有任职受雇单位，仅取得劳务报酬、稿酬、特许权使用费所得，需要通过年度汇算办理各种税前扣除的。
5、纳税人取得劳务报酬、稿酬、特许权使用费所得，年度中间适用的预扣率高于全年综合所得年适用税率的。
6、预缴税款时，未申报享受或者未足额享受综合所得税收优惠的，如残疾人减征个人所得税优惠等。
7、有符合条件的公益慈善事业捐赠支出，但预缴税款时未办理扣除的等等。
二、个人所得税专项扣除费用有哪些?
第一，子女教育：每个子女每月1000元。
第二，继续教育：每月400元。
第三，大病医疗：每年限额8万元。
第四，住房贷款利息：每月1000元。
第五，住房租金：每月800-500元。
第六，赡养老人：每月2000元。
三、个人所得税退税的流程是什么?
第一步：准备申报
安装个人所得税软件，打开软件后，先进行注册登录，进入年度汇算：首页【常用业务】—【综合所得年度汇算】;
1)进入申报界面后，填报方式有【使用已申报数据填写】 和【自行填写】两种选择。
2)为了方便申报，推荐大家选择【使用已申报数据填写】，税务机关已按一定规则预填了部分申报数据，大家只需确认即可。
3)选择【使用已申报数据填写】—【开始申报】后，系统提示【标准申报须知(使用已申报数据)】，点击“我已阅读并知晓”，开始年度汇算申报。
第二步：确认信息
需要对个人基础信息、汇缴地、已缴税额进行确认
第三步：填报数据
确认预填的收入和扣除信息无误，可直接点击【下一步】。
第四步：计算税款
数据系统将自动计算您本年度综合所得应补(退)税额
第五步：提交申报
确认结果后，点击【提交申报】即可。
第六步：退(补)税
如存在多预缴税款，可选择【申请退税】。
国家税务总局已经很详细的解释了汇算清缴的退税操作流程，除了专项扣除费用没有依法扣除的，因为其他各种原因导致年度所的不够6万元的，但按照6万元交税的，诸如此类的情形都属于退税的范围。
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