(1)针对的对象不同。行政处分针对行政机关内部工作人员;行政处罚针对行政管理相对人。
(2)作出决定的机关不同。行政处分一般由与被处分人有从属关系的行政机关作出;行政处罚由特定的和法定组织作出。
(3)针对的违法行为不同。行政处分针对行政机关工作人员的违法违纪及失职行为;行政处罚针对行政管理相对人违反行政法律规范的行为。
(4)制裁的种类不同。行政处分的种类主要有：警告、记过、记大过、降级、撤职、开除等;行政处罚的主要种类有：警告、罚款、没收违法所得、没收非法财物、责令停产停业、吊销或暂扣许可证或执照、行政拘留等。
(5)执行的程序不同。行政处分由作出处分的行政机关执行。处分决定归入被处分人的人事档案，被处分人对行政处分不服，不能向法院起诉，只能依法定程序申诉;行政处罚由作出处罚决定的行政机关自己执行或申请人民法院强制执行，被处罚人对行政处罚不服，可以申请行政复议或提起行政诉讼。
(6)两者的救济途径不同。对行政处罚不服的，除法律、法规另有规定外，相对方可申请复议或提起行政诉讼，通过行政复议与行政诉讼获得救济;而对行政处分不服的，被处分的公务员只能向作出处分决定的机关的上一级机关或行政监察部门申诉。行政处罚是行政主体为了维护公共利益和社会秩序，保护公民、法人和其他组织的合法权益，对违反行政管理秩序，依法应当给予行政处罚的行政相对方所给予的法律制裁。行政处罚与行政处分有许多共同点，主要表现在都是行政机关实施的行为，都适用行政程序等方面。
二者存在着较大的区别，主要表现在以下四个方面：
1、行政处罚是对实施了违反行政管理秩序的行政相对人的制裁，而行政处分是对违反政纪的国家公务员的惩戒;
2、行政处罚属于外部行政行为，相对方不服可以提起行政诉讼，行政处分属于内部行政行为，被处分者不服只能申诉，不能提起行政诉讼。
3、行政处罚的主体是享有相应对外管理权限的行政执法机关或法律法规授权的组织，而行政处分的主体是公务员所属行政机关或行政监察机关。
