1、作出决定的主体范围不同。行政处罚是由享有行政处罚权的行政主体作出的，这些行政主体具有对外管理职能，其行政处罚权已为法律、法规明确规定。而行政制裁是由受处分的公务员所在机构，或上级机构，或行政监察机构作出的。也就是说，一般的行政机构都享有对其工作人员的行政处分权。
2、所制裁的对象不同。行政处罚制裁的对象是违反行政法规范的公民、法人或其他组织;而行政制裁的对象仅限于行政机构系统内部的公务员。
3、采取的形式不同。行政处罚的形式、种类很多，有警告、罚款、行政拘留、吊销许可证执照、责令停产停业、没收财物等;而行政制裁的形式只有警告、记过、记大过、降级、撤职和开除等六种形式。
但如果由违法行为人住所地行政主体管辖更为方便的，经与行为发生地行政主体协商也可由违法行为人住所地行政主体管辖。
(二)两个以上行政主体对同一违法行为都有处罚管辖权的，或者违法行为地点难以查明的，由最先查处的行政主体管辖。
(三)行政主体如认为自己所查处的违法行为已构成犯罪的，应将案件移送司法机构。司法机构依法认定确属犯罪，则依法追究刑事责任;若该行为尚未构成犯罪，则应将案件退回行政主体，由行政主体依法处理。
(四)两个以上的行政主体对行政处罚权发生争执的，应协商解决，协商不成，报请其共同的上级行政机构指定管辖。
(五)行政处罚的级别管辖由具体法律、法规规定。但上一级行政机构有权管辖下一级行政主体管辖的行政处罚案件;下级行政主体对所管辖的处罚案件，如认为确有必要，可以报请上一级行政机构管辖。
(六)行政主体实施行政处罚，如果违法行为人、证人、关系人不在其管辖的行政区域，可委托这些人员所在的行政区域的行政机构讯问或调查取证，受委托的行政机构有义务协助。
行政处罚和行政制裁的区别体现在多种方面，对于行政案件来说，是由违法地的行政主管机构进行处罚的，按照相应的法律规定，对当事人处以罚款、警告、没收非法所得、行政拘留等行政处罚。上一级行政机构有权管辖下一级行政机构所处理的行政案件。
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