医疗事故技术二次鉴定的启动程序有三种，分别是：卫生行政部门移交鉴定(行政鉴定)、医患双方共同委托鉴定(自行鉴定)和法院委托鉴定(司法鉴定)。
1、卫生行政部门移交鉴定(行政鉴定)：指卫生行政部门接到医疗机构关于重大医疗过失行为的报告或者接到医患双方当事人要求处理医疗事故争议的申请后，对需要进行医疗事故技术鉴定的，应当书面移交负责首次医疗事故技术鉴定工作的医学会组织鉴定。当事人自知道或者应当知道其身体健康受到损害之日起规定期限内，可以向卫生行政部门提出医疗事故争议处理申请。
2、医患双方共同委托鉴定(自行鉴定)：指医患双方协商解决医疗事故争议，需要进行医疗事故技术鉴定的，应当由双方当事人共同书面委托医疗机构所在地负责首次医疗事故技术鉴定工作的医学会组织鉴定。
3、法院委托鉴定(司法鉴定)：是指法院在民事审判中，根据当事人的申请或者依职权决定进行医疗事故司法鉴定的，交由医学会组织鉴定。
负责组织医疗事故技术鉴定工作的医学会应当自受理医疗事故技术鉴定之日起规定期限内通知医疗事故争议双方当事人提交进行医疗事故技术鉴定所需的材料。当事人应当自收到医学会的通知之日起规定期限内提交有关医疗事故技术鉴定的材料、书面陈述及答辩。
1、住院患者的病程记录、死亡病例讨论记录、疑难病例讨论记录、会诊意见、上级医师查房记录等病历资料原件；
2、住院患者的住院志、体温单、医嘱单、化验单(检验报告)、医学影像检查资料、特殊检查同意书、手术同意书、手术及麻醉记录单、病理资料、护理记录等病历资料原件；
3、抢救急危患者，一定要在规定时间内补记的病历资料原件；
4、封存保留的输液、注射用物品和血液、药物等实物，或者依法具有检验资格的检验机构对这些物品、实物作出的检验报告；
综上所述，在进行医疗事故鉴定的时候，如果当事人对于鉴定的第一结果不服或者不满意，是可以提出二次鉴定申请的，鉴定程序与第一次鉴定的程序差不多，首先需要向卫生管理部门提出申请并审批通过，二次鉴定必须满足法定条件，如果仍旧不服还可以通过法院诉讼维权。
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