二次医疗事故鉴定能否被推翻要看具体的情形。当事人可以针对医疗事故鉴定进行搜集相关证据。
由于医疗事故技术鉴定是基于医患双方共 同委托有关的医学会鉴定的，当事人对首次医疗事故技术鉴定结论不服的，可以自收到首次鉴定结论之日起15日内向医疗机构所在地卫生行政部门提出再次鉴定的申请。 从 当事人受到首次鉴定结论之日的第2天(包括第2天)计算15天，在这15天内。没有当事人向所在的卫生局提出再次鉴定的申请，那么，就视为双方当事人对初次鉴定结论的默认。初次鉴定结论即是处理医疗事故的证据。
二、医疗事故责任认定由谁来做
一般是由医疗鉴定机构出具，卫生行政部门接到医疗机构关于重大医疗过失行为的报告或者医疗事故争议当事人要求处理医疗事故争议的申请后，对需要进行医疗事故技术鉴定的，应当交由负责医疗事故技术鉴定工作的医学会组织鉴定;医患双方协商解决医疗事故争议，需要进行医疗事故技术鉴定的，由双方当事人共同委托负责医疗事故技术鉴定工作的医学会组织鉴定。
设区的市级地方医学会和省、自治区、直辖市直接管辖的县(市)地方医学会负责组织首次医疗事故技术鉴定工作。省、自治区、直辖市地方医学会负责组织再次鉴定工作。
医疗事故中医疗过失行为责任程度分为：
1、完全责任：
指医疗事故损害后果完全由医疗过失行为造成。(赔偿全部损失的100%)
2、主要责任：
指医疗事故损害后果主要由医疗过失行为造成，其他因素起次要作用。(赔偿全部损失的60-90%)
3、次要责任：
指医疗事故损害后果主要由其他因素造成，医疗过失行为起次要作用。(赔偿全部损失的20-40%)
4、轻微责任：
指医疗事故损害后果绝大部分由其他因素造成，医疗过失行为起轻微作用。(赔偿全部损失不超过10%)
实践中还存在对等责任：即医、患双方各负担50%。
责任程度的不同，对于赔偿数额的影响较大，显不了过错程序与承担责任一致的原则，比原《医疗事故处理办法》确定的只要鉴定为事故不考虑责任程度一律承担100%赔偿的内容较为公正、合情合理。
二次医疗事故鉴定能否被推翻需要看具体情形。医疗事故责任主要是有医疗鉴定机构进行鉴定，一般当事人需要书写书面形式的申请书，然后在知道侵权事件的一年以内向卫生行政部门进行提交申请，在有关部门出具鉴定书之后，可以根据其进行追责。
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