医疗事故责任人处理办法有协商处理、相关部门调解处理或者是通过仲裁的方式。双方当事人协商解决医疗事故的就比较省时省力，双方在协商完赔偿等相关问题之后签订赔偿协议书，按照协议书上执行后就处理完了。若是双方无法协商的，可以通过相关部门来进行调解，在双方自愿的前提下，出具合理的赔偿数额，若是双方没有意见的，就可有签订协议书。还可以通过仲裁来维护自身的权益，具体的介绍如下：
（一）、医疗事故处理的协商程序
1、双方当事人协商解决医疗事故的赔偿等民事责任争议的，应当制作协议书。协议书应当载明双方当事人的基本情况和医疗事故的原因、双方当事人共同认定的医疗事故等级以及协商确定的赔偿数额等，并由双方当事人在协议书上签名。
2、医疗事故争议由双方当事人自行协商解决的，医疗机构应当自协商解决之日起7日内向所在地卫生行政部门作出书面报告，并附具协议书。
1、卫生行政部门应医疗事故争议双方当事人请求，可以进行医疗事故赔偿调解。调解时，应当遵循当事人双方自愿原则，并应当依据医疗事故处理条例的规定计算赔偿数额。
2、经调解，双方当事人就赔偿数额达成协议的，制作调解书，双方当事人应当履行;调解不成或者经调解达成协议后一方反悔的，卫生行政部门不再调解。
（三）、医疗事故处理的仲裁程序
医疗事故仲裁程序有以下步骤：
1、当事人申请。提出仲裁要求的医患一方应当在纠纷发生之日起规定的时间内(即受理时效内)向医疗纠纷仲裁委员会提出书面申请。
2、案件受理。医疗纠纷仲裁委员会应当在自收到申请书之日起规定的时间内作出受理或不予受理的决定。对决定受理的应通知被诉方，并组成仲裁庭。
3、案件审理。仲裁庭处理医疗纠纷应当先行调解，在自愿合法的原则下促使医患双方达成和解协议。若调解不成功则不应久调不决，仲裁庭应当及时作出裁决。
4、仲裁的执行。仲裁裁决书自作出之日起发生法律效力，如同法院的裁判书一样，当事人必须履行。当败诉方在不自动履行仲裁裁决的情况下，胜诉方可请求法院强制执行仲裁裁决。
通过向相关部门申请调解或者是仲裁、双方当事人协商处理都是医疗事故的处理办法。在双方自愿的原则之下，协商赔偿金额能够达成一致的，那么签订协议书之后履行即可，若是无法达成一致的，那么可以向仲裁机构提出冲裁或者是通过卫生部门进行调解。
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