《医疗事故处理条例》规定负责组织医疗事故技术鉴定工作的医学会作出鉴定结论的时限是45日。这个期限是从医学会收到双方当事人提交的材料之日起计算，到出具医疗事故技术鉴定书截止。
在《卫生部关于医疗事故鉴定申请期限的批复》下发前发生的医疗纠纷，患者或家属提请医疗事故鉴定的，时效按当地原有规定执行。二000年一月十四日起，患者或其家属提请医疗事故鉴定的，时效为其知道或应当知道权利受到侵害之日起1年。
申请医疗事故再次鉴定的期限是15天。为使医疗事故争议及时得到解决，医疗事故技术鉴定的运作周期必须加以严格限定。期限自收到医疗事故技术鉴定结论的次日起计算。超过15天提出再次鉴定申请的，当地卫生行政部门不予受理。
我国的《医疗事故处理条例》规定：设区的市级地方医学会和省、自治区、直辖市直接管辖的县(市)地方医学会负责组织首次医疗事故技术鉴定工作。也就是说，如果发生医疗纠纷的地点如果是一个市辖区的，那么就是在该区的医学会负责医疗事故鉴定工作;如果发生医疗事故的地点是不设区的市，或者县的，医疗事故鉴定机构应当就是当地的市、县的卫生局的医学会。
由于是分级鉴定的，鉴定后出具的医疗事故鉴定书，分别是XX市XX区医疗事故鉴定书，或者是XX市、XX县医疗事故鉴定书!
如果对初次的医疗事故鉴定结论不服的，往往都在鉴定文书的最后一页，规定当事人可以在15日内，向省、自治区、直辖市医学会，提出再次鉴定的申请，由省级医学会负责再次组织鉴定工作。这就是第二级医疗事故鉴定。
省级医疗事故鉴定的程序与市县级医疗事故鉴定的程序相同，鉴定机构往往设定在各地省会、直辖市卫生局、或者医学会，出具的医疗事故鉴定被告为:XX省(自治区)医疗事故鉴定书。
在我国的《医疗事故处理条例》的规定中，还规定了中华医学会可以组织疑难、复杂并在全国有重大影响的医疗事故争议的技术鉴定工作。这也就是我国的第三级医疗事故鉴定了!不过，与前两级医疗事故鉴定程序不同，中华医学会接受的医疗事故鉴定又了两个条件：第一、是不服市县级医疗事故鉴定和省级医疗事故鉴定的鉴定结论，也就是说前两级的医疗事故鉴定都已经做过!中华医学会是不可以直接作为第一、第二鉴定级，直接接受医疗事故鉴定的;第二、中华医学会接受的鉴定案件，只能够是病历疑难、复杂并在全国有重大影响的医疗纠纷案件。符合“重大、复杂、疑难”的标准并不容易，因此，中华医学会受理的医疗事故鉴定的案件的数量是极少的。
进行医疗事故鉴定，一般是由医学会组织医学专家和法医学专家进行，鉴定过程中需要运用医学和法医学等科学知识和技术，之后对涉及到医疗事故行政处理的相关专门性问题作出鉴别、检验和判断，并且最终提供相应的鉴定结论。而该结论也是处理医患纠纷的依据，卫生行政部门处理医疗纠纷案件的法定依据。
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