1、依法鉴定原则。
在实体上，应据相关法规和技术规范进行鉴定;在程序上，应遵守鉴定人员的资格、抽取、回避等规范。违反依法鉴定的，卫生行政部门应要求重新规定。
2、科学鉴定原则。
应据医学科学原理和专业知识进行鉴定;在事实清楚、证据确凿基础上，综合分析患者的病情和个体差异，作出鉴定结论。做到事实清楚、定性准确、责任明确。
3、独自鉴定原则。
应以事实为根据，以法律为准绳，不受其他因素干扰地进行鉴定;鉴定人自己不得接受双方当事人的财产或其他利益;任何单位和个人不得干扰医疗事故鉴定工作，不得威胁、利诱、辱骂、殴打专家鉴定组成员。
4、合议制原则。
鉴定组人员应为单数，鉴定结论应当半数通过。但鉴定过程应如实记载。
5、两鉴终鉴原则。
医疗事故鉴定分为首次鉴定和再次鉴定。再次鉴定在行政处理上是终极鉴定，当事人不得又申请卫生行政部门要求鉴定。但我们认为当事人可申请重新鉴定，或依法提起相关诉讼。
医疗机构提交的有关医疗事故技术鉴定的材料应当包括住院患者的病例记录、死亡病例讨论记录、疑难病例讨论记录、会诊意见、上级医师查房记录等病例资料原件;住院患者的住院志、体温单、医嘱单、化验单(检验报告)、医学影像检查资料、特殊检查同意书、手术同意书、手术及麻醉记录单、病理资料、护理记录等病历资料原件;封存保留的输液、注射用物品和血液、药物等实物，或者依法具有检验资格的检验机构对这些物品、实物做出的检验报告;与医疗事故技术鉴定有关的其他材料。此外，在医疗机构建有病历档案的门诊、急诊患者，其病历资料由医疗机构提供;没有在医疗机构建有病历档案的，由患者提供。
医疗民事纠纷与其他民事纠纷一样，属于平等主体之间的财产关系和人身关系，属民法的调整范畴。根据 “私法自治”的原则，通常情况下，国家不予干预，因此，双方当事人可以就医疗纠纷进行协商，也可以进行民间调解和行政调解，从理论上讲，医疗合同纠纷也可进行仲裁解决，但仲裁解决医疗纠纷还不受重视。国家对医疗民事纠纷的干预表现为民事诉讼，需要当事人起诉才能发生。也可以申请卫生行政部门解决
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