公元1669年 正月
先是因乾清宫竣工后漏雨墙斜，康熙帝移居清宁宫(即保和殿)。二十六日，太和殿、乾清宫等兴工。
公元1669年 二月
钦天监正杨光先革职 先是杨光先讦告汤若望而任钦天监正后，因于天算学不精，推算康熙八年闰十二月差误等，欲托疾去职，不允。康熙七年十二月，南怀仁奏言所颁民历不合天象，寻会议、测验，以南怀仁所算与天象合。杨光先言：“臣不知历法，惟知历理。”初七日，被夺职。旋以南怀仁为钦天监副。于是“大统”、“回回”两法俱废，专用西法，如顺治初。后南怀仁劾杨光先诬陷汤若望，应反坐，敕免议。
初八日，挑浚京师护城河，以护城河淤泥填塞，水不通流，从工部题请，命修浚之。
公元1669年 三月
实行“更名地” 初八日，命直省故明废藩田产，免其易价，改入民户，名为“更名地”，令其耕种，照常征粮。
公元1669年 五月
康熙帝擒权臣鳌拜 先是辅政大臣鳌拜结党擅权，势焰嚣张，恣意妄为，贪聚贿赂，且以康熙帝幼，肆行无忌，独揽国事，不请辞政。康熙帝得太皇太后懿旨，与索额图谋划，伺鳌拜入见日，命羽林士卒擒之(一说：选小内监强有力者习布库戏，一日鳌拜入，命布库擒之)。十六日，命议政王等勘审鳌拜。
鳌拜被革职拘禁 康亲王杰书等遵旨勘问鳌拜欺君而擅权、文武各官尽出门下，引用内外奸党、致失天下人望，政事先于私家议定、启奏官员带往私门商酌，倚恃党恶紊乱国政、喜者荐举恶者陷害，将苏克萨哈灭族、又将苏纳海等擅杀，欺君贪揽事权、延挨不请辞政等罪款三十，遏必隆阿附鳌拜罪款十二，辅国公、大学士班布尔善附和鳌拜罪款二十一，鳌拜之侄塞本得罪款六。二十八日，命将鳌拜革职、籍没、拘禁；子那摩佛免死拘禁，弟都统穆里玛、侄塞本得及其党大学士班布尔善、吏部尚书阿思哈、兵部尚书噶褚哈等俱立斩；遏必隆以未尝结党、咎在瞻顾谄附，削去太师及后加公爵；余俱降革有差。
公元1669年 六月
初五日，鳌拜弟内大臣巴哈革职为民。
初七日，从南怀仁言，改造黄道经纬仪、赤道经纬仪、地平经仪、地平纬仪、纪限仪、天体仪等六仪。
十一日，禁王公大臣家下商人赴各省贸易。
停止圈占房地 以“将民间房地，圈给旗下，致生民失业，衣食无资，流离困苦”，十七日，命自后圈占民间房地，永行停止。
公元1669年 七月
初一日，裁直隶、山东、河南总督。
苏纳海等昭雪 先是准苏克萨哈案内文武官员复原官，十一日，予原户部尚书苏纳海、总督朱昌祚、巡抚王登联昭雪。
吴明烜以谎称能推算南怀仁新法及制造星仪违限，二十四日，命责四十板。
公元1669年 八月
禁复立天主教堂 先是南怀仁等呈告杨光先依附鳌拜，捏词陷人，汤若望应复通玄教师之名。十一日，命杨光先从宽免死，天主教除南怀仁等外，禁止直省复立教堂传教。寻予汤若望祭葬如例。
廿四日，命索额图为内国史院大学士。
公元1669年 九月
初四日，京师地震有声。
廿九日，以林丹汗之孙布尔尼袭封和硕亲王。
公元1669年 十月
初九日，重修卢沟桥工成。
公元1669年 十一月
廿三日，太和殿、乾清宫告成，翌日御殿行庆贺礼，由武英殿移居乾清宫，并颁恩诏十五款。
公元1669年 是岁
经学家刁包死，著有《易酌》、《四书翊注》等。
丁耀亢死，著小说《续金瓶梅》等。
