天历元年(1328年)八月的大都政变之后,燕铁木儿便以佥枢密院事之职参与机要,实际上已经控制了中枢决策大权。九月,文宗继位后,立即封燕铁木儿为太平王。将太平路(今广西大新一带,治所在崇左西北)作为他的食邑,此外还赐金500两、银2500两、钞一万锭、平江(今江苏苏州市)官地五百顷。接着,文宗又授给燕铁木儿开府仪同三司、上柱国、太师、太平王、答剌罕、中书右丞相,录军国重事、监修国史、提调燕王宫相府事、大都督、领龙翊亲军都指挥使司事。凡号令、刑名、选法、钱粮、造作,一切中书政务,悉听总裁”(《元史》卷138《燕铁木儿传》)。从此,燕铁木儿成为居皇帝一人之下,万人之上,集军政大权于一身的权臣。其子唐其势甚至扬言:天下本我家之天下。
同年十月,文宗下诏从今以后,朝廷所有政务和对群臣的赏罚,如果没有与燕铁木儿商议,任何人不得上奏皇帝。天历二年(1329年)正月,设立燕铁木儿任都督的都督府,统领钦察卫、龙翊卫、哈剌鲁东路蒙古二万户、东路蒙古元帅府。使燕铁木儿名正言顺地掌握了一大批精锐部队,成为专权擅政的后盾。同月,文宗还任命燕铁木儿为御史大夫,让他掌握了司法、监察大权。
在文宗退位期间,燕铁木儿不仅一切官爵照旧;还被明宗加授太师的头衔。文宗复位之后,诏谕廷臣曰:凡今臣僚,唯丞相燕铁木儿、大夫伯颜许兼三职署事,余者并从简省(《元史》卷32《文宗纪》)。乃遍赏天历之初为其效命的阿速军士。擢燕铁木儿独任丞相,总裁天下之事。镇压了企图以明宗太子为名发动政变的蒙古贵族。动用数省兵力,历时一年,平定了驻在云南的蒙古诸王举反。
文宗进而还仿效英家推崇拜住的先例,在至顺元年(1330年)二月,将中书左丞相伯颜调任枢密院的知院,正式规定中书省只设燕铁木儿一名右丞相不再设左丞相,以保证事权的集中。这一做法实际上保障了在此后三年之中,燕铁木儿对朝政大权的专擅。
同年三月,文宗封皇子阿剌忒纳答剌为燕王,作为立太子的第一步。同时,任命燕铁木儿统领官相府,掌管燕王府邸事务。后来,燕王果然被立为太子。为褒扬燕铁木儿,文宗下令在大都北郊为他树立记功碑。六月,文宗又一次下诏褒奖燕铁木儿。诏书先称赞他勋劳卓著,忠勇无比,所以应该享有太师、太平王、答剌罕、中书右丞相、录军国重事等11个头衔,并独揽朝纲。然后重申凡号令、刑名、选法、钱粮、造作,一切中书政务,悉听总裁。要求诸王、公主、驸马、近侍人员和大小衙门的官员,如果胆敢越过燕铁木儿上奏,便以违背皇帝论处。再次肯定了燕铁木儿的显赫地位。
燕铁木儿钦察贵族势力的强大,引起了蒙古贵族的不满。知院阔彻伯、脱脱木儿等人密谋发动政变,以图除掉燕铁木儿。结果,被人告发,燕铁木儿立即调集钦察亲军将阔彻伯等人逮捕,下狱,处死,抄家。
这一事件之后,文宗对燕铁木儿的恩宠更为隆重优厚。至顺二年(1331年)正月,太子去世。但文宗仍让燕铁木儿掌管东宫事务,虚位以待新的太子。
四月,文宗下令在红桥以北为燕铁木儿建立生祠,立碑。八月,文宗下诏税务部门免收燕铁木儿经营产业的商业税。年底,文宗竟将燕铁木儿的儿子塔剌海收养为自己的儿子。到至顺三年(1332年)二月,文宗将还将一介武夫燕铁木儿任命为奎章阁大学士,掌管奎章阁学士院的事务。
燕铁木儿权势熏天,文宗优礼有加,助长了他的荒淫无度。例如燕铁木儿将泰定帝的皇后娶为夫人。
前后所娶的妇女之中,仅宗室女子就有四十人之多。后房的侍妾多的连他自己都不能完全认识,以至于身体越来越弱。
至顺三年(1332年)八月,文宗去世,遗命传位给明宗之子。燕铁木儿为巩固自己的权位,主张立文宗之子燕帖古思。文宗皇后不听,诏命立在京的明宗次子懿琳质班。十月初四,年仅七岁的懿琳质班即位,是为宁宗,仍以燕铁木儿执掌朝政。十一月二十六日,宁宗夭折。燕铁木儿再次请求立燕帖古恩,太后仍不同意,下令立明宗长子妥欢帖睦尔。这时,被文宗放逐的妥欢帖睦尔仍然远在广西静江(今广西桂林市)。朝中大政均由燕铁木儿裁决,以太后之命下达。
元统元年(1333年)春,妥欢帖睦尔到达良乡。燕铁木儿故意拖延即位之日。
直到燕铁木儿因荒淫过度,溺血而死之后,妥欢帖睦尔才在六月初八即位于上都,是为顺帝(莫久愚、赵英主编《中国通史图鉴》,内蒙古大学出版社,2001年3月版;内蒙古社科院历史所《蒙古族通史》,民族出版社,2001年版)。
顺帝在位时,虽间或有政治清明期,但并未使朝政趋于平稳,曾让伯颜专权,激化了社会诸方面矛盾,再加上天灾人祸频仍,最终使大元帝国在农民起义的烈火中分崩离析。