新生儿消化道二次手术问题是一个常见问题，家长都不希望自己的孩子手术后还需要再手术，而医生也同样希望不需要二次手术，但临床实际中二次手术是无法避免的，有时也是最佳选择。一般在新生儿期行首次手术，在三个月至半年后行二次根治术。
患儿需要二次手术通常包括两种情况，一种是疾病是先天性的，新生儿期不允许手术时间太长，手术无法将疾病彻底根除，为了避免手术风险，降低新生儿死亡率，手术解决主要的外科问题后，通过体液的管理和调整稳定新生儿的生命体征，使治疗风险处在可管控范围内。第二种是由于治疗的局限使手术未完全达到目的，或手术后出现手术并发症，如消化道梗阻等。由于并发症导致二次手术的概率为2%~3%。
胎儿消化系统疾病一般在新生儿期就需要手术，如胎粪性腹膜炎肠梗阻，需要在新生儿期通过手术解除梗阻，但手术中若见到肠管由于粘连和组织坏死无法进行吻合时，就需要行近端肠管造瘘，待三个月至半年后再考虑行肠吻合，也就是说需要二次手术。这一类情况的二次手术多是一种选择性的，虽然第一次手术是急诊，但因为将风险分担给第二次手术，所以降低了第一次手术的高风险，在手术时间、小儿手术耐受及小儿的体液管理方面都优于一次完成手术。除了胎粪性腹膜炎肠梗阻外，肛门闭锁、先天巨结肠并小肠结肠炎等都可以采取二次手术治疗方案来达到治愈的目的。这种二次手术的预后通常良好，但需要家长在二次手术前协助做好患儿造瘘口的护理，勤洗勤换，使造瘘口达到二次手术的标准，即干洁、无红肿感染等。而另一种情况的二次手术通常是一种再次急诊，多因为肠吻合出现瘘或梗阻，需要再次手术解决问题，此时小儿的病情均会较重，需要家长理解和配合，并理性分析发生的原因。二次手术能否达到目的，是否需要三次手术等问题，需要找专业医生或上级专家配合会诊解决。二次手术问题有时很简单，但有时会很复杂，需要慎重考虑和认真对待。
