区别1：发热程度不同
幼儿急疹和手足口病虽然都有发热的症状，但幼儿急疹是突发高热，在出疹后体温就会下降恢复正常，而手足口病是发低热，且发热同时就出现皮疹了。
区别2：症状大不同
幼儿急疹常常突然发生高热，伴食欲不振，少数患儿还可出现嗜睡、恶心、呕吐、咳嗽，枕后和颈部淋巴结肿大。3～5天后体温开始下降，约24小时内降至正常。热退时出现玫瑰色斑丘疹，起病初在患儿悬雍垂两侧见有小结节状隆起，周围充血，成晕状粘膜斑。
手足口病急性起病，发热、口痛、厌食、口腔黏膜出现散在疱疹或溃疡，位于舌、颊黏膜及硬额等处为多，也可波及软腭，牙龈、扁桃体和咽部。手、足、臀部、臂部、腿部出现斑丘疹，后转为疱疹，疱疹周围可有炎性红晕，疱内液体较少。手足部较多，掌背面均有，皮疹数少则几个多则几十个，消退后不留痕迹，无色素沉着。部分病例仅表现为皮疹或疱疹性咽峡炎。
区别3：传染程度不同
幼儿急疹虽然有传染性，但传染性不大，除非是亲密接触患者，否则被传染上的机率是不大的。并且是父母们完全可以通过加强锻炼，提高宝宝的免疫力和抵抗力，保持宝宝生活的环境的整洁干净来阻止被传染。
手足口病也具有传染性，而且是全球性传染病，世界大部分地区均有此病流行的报导。手足口病主要是通过人群间的密切接触进行传播的，患者咽喉分泌物及唾液中的病毒可通过空气飞沫传播。唾液、疱疹液、粪便污染的手、毛巾、手绢、牙杯、玩具、食具、奶具以及床上用品、内衣等通过日常接触传播，亦可经口传播。接触被病毒污染的水源，也可经口感染，并常造成流行。门诊交叉感染和口腔器械消毒不严也可造成传播。
区别4：发生年龄不同
幼儿急疹常发于6～18月的宝宝，3岁后少见。幼儿急疹一年四季都能发，但相比之下，春、秋雨季发病较多。而麻疹好发于6个月到5岁的宝宝，但成人受到传染也会发病。一年四季均可发病，以冬春季节多见。手足口病多发生于5岁以下儿童，一年四季均可发病，以夏秋季多见，冬季的发病较为少见。
区别5：有无并发症
幼儿急疹没有并发症，但少数手足口病患者（尤其是小于3岁者）病情进展迅速，在发病1～5天左右出现脑膜炎、脑炎（以脑干脑炎最为凶险）、脑脊髓炎、心肌炎、肺水肿、循环障碍等并发症，极少数病例病情危重，可致死亡，存活病例可留有后遗症。
