鹅口疮通常在牙龈周围形成，分布位置以双颊内侧、嘴唇内侧、上颚、舌头为主，很少会出现在位置较后方的软颚上。周围无炎症反应，有斑片状白膜附着，形似奶块，但用棉签可轻轻剥去，剥去白色黏膜后，基底部充血明显。
而患有疱疹的孩子一般是患小儿疱疹性咽峡炎，症状是在齿龈、颊及上腭、咽部出现小疱疹，疱疹溃破后成为溃疡，上有淡黄色的分泌物覆盖，旁边有一圈红晕。因口腔溃疡引起剧烈疼痛，孩子常常会拒食，口腔粘膜受到炎症刺激，唾液分泌增加，加重小儿流口水现象。还伴有高热、哭闹、食欲减退等。
鹅口疮是白色念珠菌感染所引起，这种真菌有时也可在口腔中找到，当婴儿营养不良或身体衰弱时可以发病。新生儿多由产道感染，或因哺乳奶头不洁或喂养者手指的污染传播。
疱疹就是由疱疹病毒引起的，目前已知在疱疹病毒科中有八种病毒（单纯疱疹病毒1、2型，水痘-带状疱疹病毒，人巨细胞病毒，EB病毒和人类疱疹病毒6、7、8型）可造成人类疾病，这类病毒被统称为人类疱疹病毒（HHV），能引起人类多种疾病，并能长期潜伏在体内，在一定条件下发生再发感染。
鹅口疮和手足口病的区别：是否传染
鹅口疮是真菌感染，是没有传染性的，只要及时治疗，不算什么大问题。但疱疹有一定的传染性，若确诊应对患儿适当进行隔离。
由于病因的不同，鹅口疮一般只常见于2岁以内的婴幼儿。而疱疹是任何年龄都可发病，小儿疱疹性咽峡炎的话，主要侵袭1～7岁儿童，在春夏季高发。
