吴澄把人的五官跟天上的日、月、星、辰相对应，而经、络、骨、肉他又跟地上的水、火、土、石相对应，同时他还认为人内脏中的心、胆、脾、肾属于天，而肺、肝、胃、膀胱则属于地。
对于他的这个说法，汤一介等主编的《中国儒学史》中给予了这样的评价：“这个说法很容易使人联想到董仲舒‘人副天数’思想。人像天地的思想有一定的合理性，人本来就是自然的一部分，当然符合一定的自然规律。但是，把人完全比拟于自然，固然反映了寻求世界统一性原理的愿望，却难免牵强。”
对于天地间的气，吴澄说：“本只是一气，分而言之，则曰阴阳，又就阴阳中细分之，则为五行。五气即二气，二气即一气。”（《答人问性理》）
吴澄认为，天下是由阴阳二气所构成者，如果将这两气细分，还可以分出五行，那么在天地形成之前是怎样的呢？吴澄接着说：“自未有天地之前，至既有天地之后，只是阴阳二气而已。”吴澄认为，在天地形成之前就已经有了这阴阳二气。
吴澄撰《仪礼逸经传》二卷，清照旷阁刊本，书牌
吴澄撰《仪礼逸经传》二卷，清照旷阁刊本，内页
既然有了气，那就有气跟理之间的关系，吴澄最重要的观念则是“理在气中，元不相离”（《答田副使第三书》）。为什么会有这样的结论呢？吴澄又在《答人问性理》中解释到：“无理外之气、亦无气外之理。人得天地之气而成形，有此气即有此理，所有之理谓之性。”吴澄认为在理外没有气，而在气外也没有理，其实这还是理在气中的概念。
对于吴澄的这个观念，黄百家在《宋元学案》中评价到：“‘理在气中’一语，亦须善看。一气流行，往来过复，有条不紊。从其流行之体谓之气，从其有条不紊谓之理。非别有一理在气中。”黄百家认为“理在气中”这句话并不能理解为另外有一个理在气里，而其实是理与气本为一体。
这个观念其实很重要，方旭东评价说：“他所提出的‘理在气中’以及‘理者，非别有一物在气中’等说法，则包含了理气一元论的萌芽。”而徐远和在《理学与元代社会》一书中则把吴澄的这个观念看的更高：“‘理在气中’命题的提出，在理学发展史上具有重大意义，它开启了明代理气一元论的先河。”
关于无极、太极之论，吴澄的观点也很独特：“大概古今言太极者有二，当分别而言，混同为一则不可也。《庄子》云‘在太极之先’，《汉志》云‘太极函三为一’，唐诗云‘太极生天地’。凡此数言，皆是指鸿蒙混沌、天地未分之时而言也。夫子言‘易有太极’，则是指道而言也，与庄子、汉唐诸儒所言‘太极’字绝不相同。今儒往往合二者为一，所以不明。”（《答海南海北道廉访副使田君泽问》）
吴澄认为，所谓的太极其实有两个概念，一种太极本是指的天地未分时的状态，他在文中引用了《庄子》、《汉书·艺文志》以及唐诗上的说法。而后吴澄又说，儒家所说的太极跟以上的那些说法不同，但是后人将二者混淆在了一起，所以他认为有必要做一下区分，而后他接着举例说：“自宋伊洛以后，诸儒方说得‘太极’字是。邵子云：‘道为太极’，朱子《易本义》云：‘太极者，理也’，蔡氏《易解》云：‘太极者，至极之理也。’”
《贞观政要》十卷，元内府刻本，吴澄题辞一
《贞观政要》十卷，元内府刻本，吴澄题辞二
吴澄认为，到了二程之后，邵雍和朱熹所说的太极才是真正的概念。是怎样的概念呢？吴澄又说：“澄之《无极太极说》曰：‘太极者，道也’，与夫子、邵子、朱子、蔡氏所说一同。”他说自己在文中所说的太极，指的就是道。
那既然如此，要如何区分不是道的那些太极呢？吴澄说：“混元未判之气，名为太一，而不名为太极。”他认为那样的太极，本名叫太一，而不能叫太极。于是他又在这封信中指出关于太一的说法是朱熹所提出者：“朱子《易赞》曰：‘太一肇判，阴降阳升’，不言‘太极’而言‘太一’，是朱子之有特见也。朱子《本义》解‘易有太极’云：‘易者，阴阳之变；太极者，其理也’。朱子只以阴阳之变解易字。”
经过吴澄这么一分，太极的概念清楚了，接下来当然就要说太极跟无极之间的关系，吴澄在《无极而太极说》一文中称：“无极而太极，何也？曰屋极、辰极、皇极、民极，四大之极，凡物之号为极者，皆有可得而指名者也。是则有所谓极也。道也者，无形无象、无可执着，虽称曰极而无所谓极也；虽无所谓极而实为天地万物之极，故曰无极而太极。”
当年陆九渊就对周敦颐的“无极而太极”这个说法进行了攻击，认为那种观念来自于道家，为此，吴澄进行了如下的辩解：“朱子《语录》云：‘易之有太极，如木之有根，浮图之有顶’。然木之根、浮图之顶是有形之极，太极却是无形只极，无方所顿放，故周子曰‘无极而太极’。世儒读《太极图》，分无极太极为二，则周子之言有病。故朱子合无极太极为一，而曰：‘非太极之外别有无极也’，又曰‘无极即是太极’。”
对于吴澄的这番解释，汤一介主编的《中国儒学史》中予以了这样的评价：“就吴澄对无极的理解来看，也许更适合的命题是‘无极即太极’或者‘无极本太极’。按吴澄的理解，之所以加上‘无极’一词仅仅是为了表示太极的无声无臭这一特征。然而，如果真是这样的话，那么无极就不是像太极那样的实质性概念，在他的哲学系统里，是太极而不是无极才是最高的范畴。”
由此可见，虽然吴澄特别推崇陆九渊的心学，但在关键问题上，他依然替程朱理学进行辩解。从这个角度而言，把吴澄的观念视之为朱子的理学观，应该没有大的偏差。
吴澄墓位于江西省抚州市崇仁县河上镇陈村。看罢仰山书院，穿城西行，在县政府旁看见了新建的象山公园，其面积要比书院大几百倍，不知人们为何对新建古董那么热衷，而对真正的古物却不甚爱惜。
上316省道，过浒湾镇，行43公里到达抚州市，在城南右转上王安石大道，出城再驶上208国道，西南方向40余公里到达崇仁县县城巴山镇，沿途看到许多四梦酒广告，没想到把临川四梦都做成了酒，此程本未打算去拜访汤显祖，受这些广告的感染，看来回程时当前往一拜。
此时近午，眼还在疼，在路上点了两次眼药，未见有效。在巴山镇找了一家名为家乐福的餐馆，不知家乐福超市看到后，是否会认为这是侵权行为。店内无菜单，想吃什么到后厨自己选菜，我点了清淡的青菜豆腐，司机是个小伙子，我想他应当吃点肉补充体力，就给他点了牛肚，然而他却说自己不吃动物内脏，我只好自己勉强吃了几口。
走入了茂密的草丛
饭后上路，到华侨大饭店北拐驶上小窄路，路两边裸露的土壤均为桔红色，行10公里到达三公镇，左转4公里到达河上镇，来此是为了寻找元代大儒吴澄之墓，按资料记载其墓在崇仁县河上镇陈村村委会3公里的乌龟岗上。
到达陈村，恰好一酒店走出几个食客正送另几个人上车，向其打问陈村所在，原来在路上错过了转弯处，几个人围着我问到陈村找何人，并且说：“我们是镇干部，知道陈村在哪里，你要问其他人肯定没人告诉你。”我谢过几位干部，请司机退回7公里，在一小村口见到加油站西转，行3公里有一小村。
我无论如何看不出挖出的盗坑
在村中的大道上，有五、六十岁男子骑摩托车迎面过来，我挥手把他拦了下来，向其打问，其听说我是找吴澄墓，脸色即刻严肃下来，问我是什么人，来干什么，为何要找吴澄墓，比警察盘问得还要仔细，我向他解释了一翻自己的目的，他说吴澄墓他知道在哪儿，并且全村仅他一人知道，但不能告诉我，因为二十年前有盗墓贼来盗过吴墓，他问我如何证明自己不是盗墓贼。
他的这个说法颇有要证明“你妈是你妈”的奇葩，我想了一番，自己还真拿不出证据来，只好如实相告，此人让我出示身份证，我掏出后递给他，他将身份证上的信息逐字读出，连读数遍，似乎要将这些背诵下来，我听着他读着身份证上的字，感到异样而陌生，这上面写着的就是我吗？盘问一番，默念一番，此人似乎满足了，带我走进旁边的树木，原来我离此墓已不足十米远，然而墓已不存，只剩了一个高土岗，高土岗上有个凹形坑，上面长满了杂树，余外看不到任何标志性的物件。
看上去是一片高岗
可能是已经验明了正身，此人的态度缓和了许多，他说自己姓陈，自称是本村小学教师，现已退休，从小就生活在这个村内，因此了解吴澄墓的有关情况，告诉我说前几年吴澄的后人到此地取走了一袋子土，回到吴澄的家乡又建了一个新墓，我问具体地点在哪里，其称不知道，我又问此墓为什么毁坏成这个样子，他说1958年大跃进时兴修水库，就到处找墓碑和墓石来做涵洞之用，因此将吴澄墓前边的各种碑刻以及整个墓围的石条全部拉走了，到1986年又有盗墓贼在这个大墓上挖了一个大坑，因为没有用炸药，所以没能挖到深层，墓内的东西现在也未盗走，我又问他此地为何名乌龟岗，他说这块小高地上原来有一巨大的石龟，八十年代被一个村民拉走盖房子用了。
在荒草中探寻
此人边说边指我看树林中的一个凹处，而今这一带长满了杂树，我在树木内东瞧西看，已经看不出任何模样，甚至我连这里曾经有过古墓的痕迹都看不出来。我请他确认这里就是吴澄墓的旧址，他对我的质疑表示了愤慨，可是他一脸的愤怒仅持续了数秒就又变成了灿然：“你连这都看不出来，看来你真的不是盗墓贼。”
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