目前关于盘古神话来源的观点很多，不仅有地域的争论，还参合了所属民族的争论。自明代的马欢，到民国时期的屠考贤，就开始将盘古神话追溯到印度，后来的徐松石、吕思勉、高木敏雄（日本）、何新皆从此说；蒋云观在《中国人种考》一文认为“盘古”乃巴克族之名的转音，又将盘古的来源追溯到巴比伦；茅盾则是一位主张盘古神话起源于中国南方的学者，主张南方学说的学者中，又有民族的差别，比如清代的苏时学、夏曾佑、以及顾颉刚、袁珂、范文澜等主张起源于中国南方的苗瑶语族，而胡仲实、蓝鸿恩、覃彩銮等学者则主张起源于中国南方的百越民族。也有学者主张起源于中原，如马卉欣、张振犁、王晖等。
《三五历纪》里的盘古神话既然是天地人三皇起源神话，而非盘古开辟天地的神话，其根源便只能到有这种思想的文化中去寻找。其根源可以追溯到春秋战国时期的阴阳学说，那么盘古神话就排除了印度通过佛教传来的可能。关于佛教传入中国的具体年代，基本认定是在汉哀帝元寿元年（公元前2年），那一年，大月支国的使者伊存到了当时中国的长安即今西安，他口授佛经给一个名叫景卢的博士弟子。这是中国史书上关于佛教传入中国的最早记录。为此，中国佛教协会于公元 1998 年在北京举行了佛教传入中国2 000 年的盛大法会。
那是否存在不通过佛教的渠道，而是在此之前通过别的方式传入中国的可能性呢？也不可能，因为盘古神话不是一则由盘古来开天辟地的神话，印度的梵天创世神话则是一则不折不扣的神创造天地的神话。何新用来与盘古神话作比较的梵天创世神话出自《摩奴法典》，他所引用的材料如下：
宇宙大爆炸
当初这宇宙沉浸于黑暗之中……如同完全处在睡眠之中。（第6节）
于是本体神（出现。它决意要创造五大和万物，以扫除黑暗，揭示自然的奥秘。（第17节
他首先创造了水，在水中播下一粒种子。（第8节）
这种子变成一个金色的鸡卵，光明四射。于是那至重的本体神现形为大梵，而出生于这金色的蛋中。（第9 节）
他在这个蛋中整整住了十二个梵月。于是发大智慧，将蛋破分为两半。（第12 节）
于是，蛋的一半升为天，一半下降为地。在天与地之间有气和八字。周围环绕以水。（第13节）
他又以智慧创生了神性、人性和畜生性。创生了眼、耳、鼻、舌、身五识，口手足肛阴五根，创生了五大元素。（第 15 节）
从中不难看出，印度神话中天地是梵天发大智慧开辟的，而盘古神话中的盘古没有丝毫开辟的痕迹。什么是开辟神话？这一概念往往又称为开天辟地神话、天地开辟神话、宇宙起源神话、创世神话、万物起源神话，等等。人们往往不去追究这些术语的字面上的差别，其实，从文字表面来看，“起源”两字只阐述了一种现象，它可以是被创造，也可以是自然形成，而“创世”两字却暗含了起源的成因，只有人或神才能“创”。所以，起源神话应该更为广泛，包含了创世神话。天地自然起源的神话属于起源神话，天神创造天地也属于起源神话，神创只是起源的一种方式而已。梵天神话是起源神话中的开天辟地神话，而盘古神话虽然也是起源神话，却不是开天辟地神话，两者有本质的区别。
静看沧桑万年云
那么，盘古神话是否有可能来自中国南方的一些少数民族？那里也有类似三皇起源的神话，比如，壮族《布洛陀与姆洛甲》说：
“混沌时代，宇宙中旋转着一团大气，这团大气渐渐地越转越急，越转越快，形成一个蛋的样子。后来蛋爆裂开，分为三片，一片飞到上边变为天空，一片飞到底下变为水，留在中间的一片变为大地。突然，大地上长出一朵花，中间长出一个女人来，她就是始祖姆洛甲。”
这一神话与《三五历纪》中记述的盘古神话颇为相似，但人们难以判断这种思想是来源于哪里，是受到阴阳学说的影响，还是来源于对生活中卵孵化过程的观察。如果要论证盘古神话来源于此，那至少还要进一步提供壮族古代先民具有三皇观念的证据。
目前从民间搜集的很多盘古神话，包括南方少数民族的一些盘古神话，几乎都是盘古开天辟地神话，比如马卉欣先生在《盘古之神》第四章“宇宙开辟”第一节“盘古出世”中收录的8个盘古神话，以及第二节“盘古创世”中收录的17个盘古神话，全部都是盘古以各种方式开辟天地的神话。当人们了解了早期的盘古神话不含有创世的因素，就很容易理解这些神话当是早期三皇起源神话被误读为盘古开天辟地神话之后才流传开的。
