“转移定价”的操作原理尽管非常简单，但它毕竟进行的是跨国境、跨地区操作，并且至少涉及两套以上法律制度，而且进行“转移定价”操作的时间跨度都相对较长，动辄可能就是几年以上。基于这些特点，进行“转移定价”操作的企业可能会面临以下潜在风险：
一、法律风险。法律风险来自国内法律风险和国际法律风险(离岸公司注册地法律风险)两个方面。就国内法律而言，由于避税不存在非法一说，所有的避税都在“合法”下进行，因此，避税的合理性就成了问题关键。但更进一步的问题是，什么样的情形是合理的，什么样的情形是不合理的?也许这个问题该留由税务机关来最后定论。国际方面的法律风险和成本就更大了，首先它最大的风险来自你的无知或是知之甚少;其次，包括两个国家或地区的语言、文化、价值理念、司法传统、司法观念、商业环境等等在内、巨大差异性都可能使你面临风险。
二、信息风险。上面提到由于两套法律体系的差异性，并且你在进行“转移定价”操作时往往借助于外部力量，这样你所接受的信息基本上是经过处理的二手信息，或者是不全面的信息，并且其信息传递往往又具有滞后性，这些因素都会直接影响公司的正确决策。
三、代理风险。进行“转移定价”操作的公司往往本身实力和信誉可能就不佳，并且由于避税本身的敏感性，这些公司往往也不会大张旗鼓地做广告，而且注册地还在境外，一旦你与代理公司之间产生纠纷，往往主动权并不在你这里，而且维权成本极高，大部分被骗企业往往会以自认倒霉而告结。
四、经济风险。在这里有必要提及一下的是，“转移定价”针对的是企业所得税，并不包括流转税。因此，有的代理服务公司打着所谓“零”税负旗帜其实是不存在的，它们这样说本身就是一种信息传递误导行为。所以，企业的决策者们应当理性地核算一下“收益”和成本，尤其是进行“转移定价”的总成本开支，除了直接的费用开支之外，还应当将时间花费成本、精力成本、上述风险折算成的经济成本一并记入，另外还再加机会成本。这样下来，你就有了理性的判断结果。五、企业道德和企业诚信风险。避税行为虽然不违法，但它决然有违税法的立法本意，一旦税务机关经过稽查认定贵企业存在不当避税行为，除了承担相应的法律责任和经济责任之外，另外还可能使你企业的社会公众形象(包括企业道德和企业诚信)遭受巨大的损失，甚至可能是致命的，此类现实例子也不在少数。
