健康饮用水应符合以下要求：不含致病菌、重金属和有害化学物质;含适量矿物质和微量元素;含新鲜适量的溶解氧;偏碱性、水的分子团小，活性强。专家指出：正规厂家生产的饮水机和桶装水基本符合这个条件。
一、结垢：饮水机中容易出现水垢，特别是在水质硬度较高的地区。出现的白色沉淀物大部分是碳酸盐类。其实这些盐类以一种很稳定的化合物形态存在，还没有证据表明对人体有害。但这些物质的存在影响了热交换的效率，结垢严重时，会带来安全隐患。因此饮水机要及时除垢。
二、“千滚水”：这种提法不科学。饮水机的加热温度一般为85℃~95℃，没有达到沸腾的程度。但是长期加热对水的活性会产生影响，因此加热时间越长，水的活性越差，俗称“老化水”，因此在长时间不饮用时，应关掉电源，除了省电，还能避免水活性的丧失。
三、饮水机中含亚硝酸盐：由于水中都含有硝酸盐氮，当饮水机微生物污染严重时，会促使硝酸盐氮转化为亚硝酸盐氮。WHO饮用水指令中规定该指标在短期内超过3mg/L时，婴儿会发生高铁血红蛋白症。从目前的研究看还没有足够的证据表明亚硝酸盐与癌症有直接的关系。
四、细菌：当饮水机中水温超过60℃时，普通微生物就可以杀灭。80℃以上时，10~20分钟可以将芽孢杆菌杀灭。
五、加热胆的材料导致有害物质析出：多数正规企业生产加热胆所使用的材料是不锈钢，符合国家相关卫生标准。不锈钢耐受的温度远远高于沸水的温度，因此不会有有害物质析出。而一些假冒伪劣产品使用的是不卫生材料，经热水浸泡后，有害物质可以被溶解出来，就会危害健康。
使用饮水机真正的健康隐患其实是二次污染。每款饮水机都有5个与外界相通的部分，即两个龙头、进水口、空气口、排污口。饮水机的二次污染主要是空气中的粉尘携带大量的微生物、藻类等随着空气进入饮水机，特别是空气口、排水口容易形成死角，微生物在此大量繁殖，同时也污染桶装水。
在国外，使用饮水机都有专业指导，必须定期清洁。约2~3个月清洗一次，清洗时要找专业人员，自己清洗要使用专用的微酸性清洗消毒液。另外，饮水机里的水要尽快用掉，特别是夏天，最好一周内用完。
目前，一些企业针对现有饮水机的弊端进行了改进，例如袋装水、真空负压饮水机、无胆饮水机、抑菌材料的使用等，这些新型饮水机将带来更健康的饮用水。
