蜜蜂生棉虫在紧急情况时可用棉虫清木片、棉虫净、康宽等药物进行防治，虽然效果好，但这是治标不治本的方法，如果要想标本兼治还得从预防着手，如饲养强群、更换巢脾、清洁蜂箱等才能从根本上杜绝棉虫的发生。
1、药物：不能根治
中华蜜蜂最怕棉虫，一但棉虫危害严重且群势太弱而无清扫能力时蜂群便会整群逃亡，因此对养中蜂来说如果能防治好棉虫便是成功了一般，目前在市面上治棉虫的药有棉虫清木片、棉虫净、康宽等，用这些药物来治疗棉虫效果都非常不错，但却不是防治棉虫最好的办法，其实只要预防得好是完全可以杜绝棉虫的发生的。
2、预防：饲养强群
强群对棉虫有较强的抵抗能力，守卫蜂能有效的制止棉虫成虫潜入蜂巢内，护脾工蜂也能有效的防备和驱逐棉虫，使蜂群在遭受棉虫危害后其损失不明显，因此要是随时保持巢脾上有充足的蜜和粉，同时必须保证蜂多于脾或蜂脾相称，抽出多余的巢脾，一旦空脾多会就导致蜂群清巢能力减弱，很容易滋生棉虫导致蜂群飞逃。
3、预防：更换巢脾
蜂群及时更换老脾对抑制棉虫的发生有重要作用，尤其是中蜂，因为中蜂有喜新脾、厌旧脾的特点，当巢脾过旧时工蜂会将其咬掉，咬下的蜡屑堆积箱底给棉虫提供了有利的生存空间，巢脾越老滋生的棉虫就越多，因此饲养中蜂每2年更新一次巢脾，有条件的话最好是每年换一次，换下的老旧脾要及时化蜡以防棉虫到处传播。
4、预防：清洁蜂箱
棉虫多滋生于蜂箱的缝隙处或箱底的蜡屑处，因此对蜂箱进行清洁消毒可有效预防棉虫的发生，可塞死蜂箱的缝隙处使蜡螟无处产卵，经常清扫蜂箱内壁和箱底的蜡屑不给棉虫有可食的机会，可每次换箱时将蜂箱放在太阳下暴晒几个小时以杀死棉虫的卵、幼虫及蛹，也可以用浓肥皂水洗刷蜂箱，这样能保持30天蜂箱不生棉虫。
