虽然合欢树和含羞草外形比较相似，但是两者从本质上有很大的区别，主要在于植株高度的不同、叶子不同、花期不同、花朵不同，一般合欢花可高达16m左右，而含羞草大多数为1m左右，并且一触碰叶子就会闭合，而合欢树不会。
1、高度不同
虽然合欢树和含羞草外形十分相似，但是两者还是有很大的区别，一般合欢树和含羞草区别在于植株的高度不同，合欢花属于乔木类植物，植株可高达16m左右，分枝有棱角，而含羞草的高度为1m左右，相对于合欢花较矮。
2、叶子不同
含羞草的叶子呈披针形，一般长度为5～10mm左右，上面有细小的软毛覆盖，只要一触碰叶子就会闭合，而合欢树的叶子呈羽状，叶柄和基部有明显的纹理，长度为6～12mm左右，触碰后叶子不会闭合，这也是两者最大的区别。
3、花期不同
含羞草一般是在每年的3～10月份开花，它的果期是在5～11月份，而合欢树是在每年夏季的6～7月份开花，果期是在8～10月份，也可以通过花期进行区别两者。
4、花朵不同
合欢树的花序较大，主要呈扇形，花粉为红色，花冠一般在8mm左右，花柄和花亭上都带有软毛，而含羞草的花序较小，花朵为圆形，花色主要为淡红色，花萼极小，对比起来合欢树的花朵比含羞草大很多，所以还是很容易区分二者的。
