1、清水清洗：应该马上用适量温水将吸管杯浸泡数分钟，然后再用清水冲洗2~3遍。清水冲洗是最简便的办法，冲洗过程中流动的水有助于祛除异味、带走细菌与污垢。
2、食醋浸泡：吸管杯内倒入适量的食用醋，然后拿起杯子摇晃，让有污垢的地方都浸泡到食用醋。多次摇晃后，将杯子静止20分钟。就可以看到杯子上的水垢脱落。再加入温水继续浸泡半小时后就可以了。需要注意的是为了避免杯子有醋味，用醋浸泡的次数不应过多。
3、吸管杯最难清理的地方就是那细长的吸管了。里面容易沉积水垢，又不易冲洗掉，看起来就觉得脏。其实清洗吸管可以使用专用的吸管刷来进行清洗，如果没有吸管刷的还有其它的小妙招，如可以找出细长的发卡，勾住毛线，然后穿过吸管，来回摩擦的方法来清理污垢。
4、煮沸消毒：是家里常用的方便的消毒方式。首先需要准备一个专门用来消毒的锅，然后加入将吸管杯浸泡的水量，再大火煮沸后3~5分钟取出即可。如果是不耐高温的吸管杯则需要使用蒸气锅来进行消毒了。
