1、两者含义不同：有机物：狭义上的有机化合物主要是指由碳元素、氢元素组成，一定是含碳的化合物，但是不包括碳的氧化物和硫化物、碳酸、碳酸盐、氰化物、硫氰化物、氰酸盐、碳化物、碳硼烷、羰基金属、不含M-C键的金属有机配体配合物，部分金属有机化合物（含M-C键的物质）等主要在无机化学中研究的含碳物质。无机物：与机体无关的化合物(少数与机体有关的化合物也是无机化合物，如水），与有机化合物对应，通常指不含碳元素的化合物，但包括碳的氧化物、硫化物、碳酸盐、氰化物、碳硼烷、羰基金属等在无机化学中研究的含碳化合物，简称无机物。
2、两者命名方法不同：有机物：有机化学物有两种命名法，其一是“普通命名法”也称习惯命名法。要求掌握“正、异、新”、“伯、仲、叔、季”等字头的含义及用法。其二是“系统命名法”，系统命名法是有机化合物命名的重点，必须熟练掌握各类化合物的命名原则。其中烃类的命名是基础，几何异构体、光学异构体和多官能团化合物的命名是难点，应引起重视。要牢记命名中所遵循的“次序规则”。无机物：应力求简明而确切地表示出被命名物质的组成和结构。这就需要用元素、根或基的名称来表达该物质中的各个组分；用“化学介词”(起着连接名词的作用)来表达该物质中各组分的连接情况。
3、两者反应不同：无机物：溶解度较大、反应快，情况种类比较复杂。有机物：熔点较低，有机物的极性很弱，大多不溶于水，有机物之间的反应缓慢。
