单纯性肥胖的原因比较复杂，有遗传的影响，有环境因素的作用，还与个人体质特点有关。这些因素相互交错，难以划分各自的明显界线，值得注意的是，儿童肥胖有两个高发期：
一是婴儿期(即1岁以内的孩子)。在婴儿期，孩子活动范围小，吃的食物又营养丰富，加上有的家长给孩子进食不予控制，孩子一哭就给他吃东西。这么一来，便出现肥胖，在婴儿期肥胖的孩子，到二三岁后肥胖现象可以改善，但有一部分则持续发展，一直维持到成年。
二是学龄初期(即6-8岁儿童)。中度以上单纯性肥胖的学龄儿童，开始发胖的年龄多在7岁左右。这个时期的儿童，就餐常不够规律，且有进食过快的习惯。有学者认为，进食过快与肥胖有关。另外，学龄初期的儿童多注重吃主食，而且吃得多，对吃蔬菜则往往忽视。其结果是使体内多余的热量转化为脂肪，导致肥胖。
