能够引发手足口病的病毒多达数十种，但最常见的是柯萨奇病毒A16型和肠道病毒71型（EV71）。可以说由这两类病毒引发的手足口病占到整体发病情况的70%左右。其中EV71型病毒是手足口病的主要原因可以通过疫苗来预防。
由于EV71母传抗体水平出生后逐渐衰减，在婴儿5-11月龄时最低，而发病率最高的年龄组在6月龄-2岁 。因此，6月龄开始接种可及时为易感儿童提供保护 。由于5岁以上儿童和成人的发病率很低，故可推测，5岁以上人群使用EV71型手足口病疫苗，无论在个体层面还是群体层面，其公共卫生意义有限、成本效益欠佳 。
此疫苗对预防由EV71引起的手足口病的保护率可以达到 97.4%，预防由EV71引起的重症手足口病的保护率可以达到100.0%，能够有效降低我国儿童手足口病的发病率，并减少该病的重症及死亡病例。
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