铜绿假单胞菌广泛存在于自然界，为条件致病菌，完整皮肤是天然屏障，活力较高的毒素亦不能引起病变，正常健康人血清中含有调理素及补体，可协助中性粒细胞和单核细胞巨噬细胞吞噬及杀灭铜绿假单胞菌，故亦不易致病。
铜绿假单胞菌属条件致病菌，侵袭性弱。但是如果改变或损伤宿主正常防御机制，如皮肤黏膜破损、留置导尿管、气管切开插管，或免疫机制缺损如粒细胞缺乏、低蛋白血症、各种肿瘤患者、应用激素或抗生素的患者，在医院环境中常可从带菌发展为感染。烧伤焦痂下，婴儿和儿童的皮肤、脐带和肠道，老年人的泌尿道，常常是铜绿假单胞菌败血症的原发灶或入侵门户。
铜绿假单胞菌感染常常会引发败血症、呼吸道感染、心内膜炎、尿路感染、中枢神经系统感染、骨关节感染、眼部感染、耳、乳突及鼻窦感染、皮肤软组织感染、消化道感染，有些疾病会严重的威胁病人的生命安全。因此为了防止继发感染，在医院里必须严格消毒器械、敷料，医务人员及护理员勤洗手，认真执行无菌操作，患者应予隔离，其敷料应予焚毁。同时积极治疗原发疾患，去除诱发因素等。
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