水是人类最宝贵的资源，是人类赖以生存的物质基础。进入21 世纪以来，水资源危机也成为人类面对的严峻问题之一。近年来，我国的水污染问题日益严重，对我国农业生产产生很大的影响，特别是我国较为关注的食物安全问题。
目前，水体污染对食品安全的影响主要体现在以下几个方面：
1.水体无机物对食品的污染，水体中的无机污染物包括无机阴离子、金属及其化合物。水体中无机盐增加能提高水的渗透压，对淡水生物、植物生长产生不良影响。在盐碱化地区，地面水、地下水中的盐将对土壤质量产生更大影响，导致农作物产量下降甚至绝收。
2.致病微生物对食品的污染，生活污水、畜禽饲养场污水以及制革、洗毛、屠宰业和医院等排出的废水，常含有各种病原体，如病毒、病菌、寄生虫。水体受到病原体的污染会传播疾病，如血吸虫病、霍乱、伤寒、痢疾、病毒性肝炎等。
3.植物营养素对食品的污染，植物营养物主要指氮、磷等能刺激藻类及水草生长、干扰水质净化，使BOD5 升高的物质。大量氮、磷植物营养物质排入水体后，促使某些生物(如藻类) 急剧繁殖生长，死亡后被需氧生物分解，不断消耗水中的溶解氧，产生硫化氢、氨和硫醇等难闻气味，使水质进一步恶化。由于水体中的含氧量少、又含有很多有毒物质，造成了鱼类和其他水生生物的大量死亡。
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