江苏目前已知的污染来源主要是化工，其他比较明显的有铅蓄电池、农药、金属冶炼等行业。在确定的污染物类型中，有机物污染约占37%，重金属污染约占22%。已经关闭化工企业6000余家，此外还有关闭的矿山1500多座。
工业“三废”排放是苏南土壤污染的重要途径。工业三废中含有多种有毒、有害物质，若不经妥善处理，如未达到规定的排放标准而排放到大气、水域、土壤中，超过环境自净能力的容许量，就对环境产生了污染，破坏生态平衡和自然资源，影响工农业生产和人民健康。2007年发生的无锡太湖蓝藻事件就是由围绕太湖周边大量化工企业排放污染物进入太湖水域所引起的，当时无锡市民众饮用水出现短缺，造成恶劣影响。
超标或者违规大量使用化肥农药造成土壤、粮食作物受污染的现象严重，导致农业生产的环境生态受到破坏。调查还发现，苏南农村机械化的普及，农民摒弃了传统农耕方式，带来的问题就是机械化劣质油品造成的空气和土壤污染。
另外，江苏省地方政府鼓励扶持乡镇企业的发展，其中某些企业技术含量低，环保意识差，以牺牲环境为代价来获得经济利益，也在加剧农业生态环境的污染。
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