土壤污染物大致可分为无机污染物和有机污染物两大类。无机污染物主要包括酸、碱、重金属，盐类、放射性元素铯、锶的化合物、含砷、硒、氟的化合物等。有机污染物主要包括有机农药、酚类、氰化物、石油、合成洗涤剂、3，4-苯并芘以及由城市污水、污泥及厩肥带来的有害微生物等。
重庆农田重金属含量水平既受到成土母质等地球化学特征的深刻影响，同时又受到人为因素的强烈作用。土壤重金属来源于工矿企业的污水排放与污水灌溉、化肥的大量使用与生态农业，化肥中常含有不等量的副成分，大多是重金属元素、有毒有机化合物以及放射性物质，施入土壤后发生一定程度的积累，形成土壤潜在污染。
土壤重金属污染来源于水体污染、大气污染、固体废物、农药和化肥等多种途径。土壤污染的另一重要来源是污水灌溉，发达国家污水大多经过处理，而且在污灌方面总结出较完整的经验。我国的污水处理率较低，矿区、工厂污水未经处理任意排放，使附近农田遭受污染之事屡见不鲜，特别是在城市郊区污灌和污泥施用区，土壤污染更为严重。气源重金属微粒是农田重金属污染的途径之一，它的构成主要是金属飘尘，不仅来自未经处理的工业废气排放，还来自生活能源燃煤的废气排放。固体废弃物污染：含有较高重金属的固体废弃物或矿砂堆积也是农业环境中的重金属污染源
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