生态农业的优点有很多，能够保护和改善生态环境，防治污染，维护生态平衡，提高农产品的安全性，变农业和农村经济的常规发展为持续发展，把环境建设同经济发展紧密结合起来，在最大限度地满足人们对农产品日益增长的需求的同时，提高生态系统的稳定性和持续性，增强农业发展后劲。
由此可知，生态农业的发展提高了食品的安全性。例如德国生态农业的要求是不使用化学合成的除虫剂、除草剂，使用有益天敌的或机械的除草方法;不使用易溶的化学肥料，而是有机肥或长效肥;利用腐植质保持土壤肥力;采用轮作或间作等方式种植;不使用化学合成的植物生长调节剂;控制牧场载畜量;动物饲养采用天然饲料; 不使用抗生素;不使用转基因技术。
作为生态产品必须符合"国际生态农业协会(FOAM)"的标准，如产品如何生产，哪些物质允许使用，哪些物质不可使用等等。生态产品在生产过程中，其原料必须是生态的。所采用的附加料如在生产过程中必须使用，则允许部分附加料来自传统农业，但不得高于25%。一旦使用了传统农业附加料，则应在产品中标明使用的比例。只有95%以上的附加料来自生态的，才可作为纯生态产品出售。某一企业欲加入"生态农业协会"，将其产品作为生态产品销售，必须经过3 年的完全调整方可。并由国家授权的检测中心对申请转入生态农业生产的企业进行检查，检查至少每年进行一次，此外也可不定期进行抽查。如检查不合格，则要延长调整期。
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