有观点认为，胆囊切除术后容易出现胆道功能障碍、术后肠梗阻、结肠癌、术后腹泻、返流性胃炎、反流性食道炎等缺点。但在临床中发现，除了术后进食高脂饮食后有不到5%的患者容易出现大便次数增加外，其余表现很罕见，而且一般经过1年后，多数患者的腹泻可以通过自身调节而消失。实际上，得了胆囊结石后，很大一部分患者胆囊已经没有浓缩功能。
因个体差异不同，消化不良的症状大概会持续3个月至半年左右，随着时间的推移，胆总管逐渐扩张，会部分替代胆囊的作用，消化不良的症状也就会慢慢缓解，这时饮食也就能逐步过度到正常了，因此不必担心胆囊切除后胆汁无法存储的问题。
若是胆囊已被切除，不可能再有胆囊结石，所谓“皮之不存，毛将焉附”。而保胆后2年的结石复发率，国内外报道均在40％～80％之间，多数患者会被迫进行第2次手术，而第2次手术会因为第一次手术后发生粘连而增加难度和危险性。由此可见，胆囊患者坚持选择保胆手术，是没有多大必要的。
