圣女果和西红柿本质上都同属于茄科，只是在外形大小和颜色上略有差异而已。西红柿比较大个，圣女果比较小，颜色普遍略发暗红。圣女果的营养价值和大西红柿基本相同，但部分成分优于普通西红柿。
1、从外形上区分
圣女果又名小西红柿，所以，外形上圣女果要比西红柿小得多。另外，圣女果果形有球形、洋梨形、醋粟形，西红柿果形则一般是椭圆形或方圆形。
2、从颜色上区分
圣女果的颜色一般有红色、黄色、粉色、橙色，而成熟的西红柿一般是红色的。这也是最直观的区别圣女果和西红柿的方法之一。
3、从营养价值上区分
圣女果的营养价值比普通西红柿的要高出许多，维生素含量更是普通番茄的1.8倍，圣女果中维生素pp的含量还是果蔬之首。另外，圣女果中含有的特殊物质谷胱甘肽和番茄红素能够促进人体的生长发育，尤其对小孩的生长发育有益。
4、从口感上区分
在口感上圣女果明显要优于西红柿，圣女果的甜度比西红柿高，汁多，而西红柿带有一点酸的味道。
5、从食用方法上区分
