缩阴术可能会术后感染
原因主要是因体质差，阴道炎症未治愈，术前准备不充分，或术中无菌操作不严格所致。会出现阴道异常分泌物，有臭味，重者出现体温升高，白细胞计数升高等全身症状。这时要加强全身抗感染治疗，局部换药，保持外阴清洁，多可治愈。
缩阴术可能会损伤周围脏器
术者解剖层次不清，手术操作粗暴，钳夹组织过多，缝合过深等，导致膀胱、直肠或尿道损伤。术中有尿液或粪便溢入阴道，或术后一段时间阴道内有异常分泌物、臭味等。术中发现损伤者立即手术修补；术后一段时间发现者择期修补。
缩阴术可能导致出血和血肿
术中剥离面过大，止血不彻底，结扎不牢固，或手术操作粗暴，组织损伤过多所致。术后阴道有鲜红色血液流出，或有下坠感和憋尿感，后壁血肿肛指检查可触及血肿包块。少量出血或小血肿，可用纱布填塞阴道，局部压迫止血即可。大量出血或大血肿，应及时拆开缝线，清理积血，找到出血点重新缝扎，彻底止血，术后加强抗感染治疗。
手术设计不妥，切除黏膜范围过大，或感染后创面挛缩所致。性生活痛，重者不能性生活。轻度者用阴道扩张器扩张，重度者行松解术或植皮。
缩阴术可能导致伤口裂开
切除组织过多导致伤口张力过大，创缘对合不好，过早做剧烈活动，术后便秘及伤口感染等。多在剧烈活动或便秘排便时出现阴道不等量活动出血。立即重新缝合，加强抗感染治疗，卧床休息。
缩阴术可能导致缩进不足
缩小后，达不到患者理想程度。性生活是复杂过程，手术无法改善因感情不融洽、生活压力大等其他原因引起性生活不满意。
