变应性鼻炎伴发疾病可分为相同的致病途径（如变态反应）或合并其他疾病（黏膜肿胀，黏液潴留引起的合并感染）。包括哮喘、结膜炎、慢性鼻-鼻窦炎、腺样体肥大、分泌性中耳炎等。变应性鼻炎的存在加重哮喘，大多数哮喘患者患有变应性鼻炎。室外变应原较室内变应原更易引起变应性结膜炎。
不及半数的花粉症患者和部分常年性过敏性鼻炎患者会发生支气管哮喘。这是由于过敏性支气管病变所致，其致敏物也与过敏性鼻炎一致。一般在鼻部、眼部症状出现后数年才有支气管哮喘，在哮喘发作之前先有持续性、久治不愈的咳嗽，这是哮喘的前驱症状，由过敏性气管炎所致。极少数患者哮喘与鼻部、眼部症状同时出现。
由于肿胀或水肿的鼻粘膜与咽鼓管粘膜相连接，因此，咽鼓管粘膜也可以发生同样病变。当咽鼓膜粘膜肿胀和水肿达到一定程度时，可导致咽鼓管阻塞、中耳腔积液，并出现传音性耳聋，这就是过敏性中耳炎。
