由于药酒是用酒精浸泡而成，饮用必须因人而异。酒精能抑制甲状腺素的有效分泌，长期饮白酒的老人，白内障、骨质疏松症的发病率明显增高。妇女在妊娠期、哺乳期不适合饮用;在行经期，即使月经正常，也不宜服用活血性能强的药酒。
药酒包含酒和药物的双重功效。饮酒的确可促进睡眠，但酒后的睡眠状态与正常生理性睡眠并不相同。因为喝酒后入睡，大脑并没有真正休息，所以并非真的达到休息的状态。有时喝了药酒后入睡，醒来后会有头重、头痛等不适症状。
药酒有养生滋补的作用，但并非多喝就有益身体健康。药酒含有药材，大量饮用药酒的后果无异于过量服用药物。服药酒次数一般每日早晚各一次，每次半两左右，不善饮酒的可在睡前服少许。不应长期持续饮用药酒，特别是老年人。
许多家庭在选购成品药酒的同时，还常常喜欢使用民间验方，自己动手制作药酒，但他们往往是在对药性、剂量不清楚，不了解配制常识，也不懂得对症服用的前提下盲目配制，结果发生意外。
