胶原蛋白是我们人体中本来就含有的物质，只要是通过高品质的原料用专业的高水平生物分解技术提取制成的胶原蛋白制品都是可以信赖没有副作用的。但是如果是使用了劣质的原料，而且加工过程中没有通过专业的生物萃取技术，那么这样的胶原蛋白就可能会对人体产生副作用。
高质量的胶原蛋白使用的原料一般都来自于深海鱼皮，所以成本也比较高，但是劣质胶原蛋白的原料可能就会使用相对廉价的浅水鱼鳞之类的，但是，由于现在工业的发展，各种污染可能就导致浅水鱼受到了各种疫病感染，而且劣质的胶原蛋白为了节约成本，脱腥脱臭的工作一般都做不到位，这就导致了浅水鱼中很多有害的物质被残留在了胶原蛋白的成品之中。如果服用或者使用这样的胶原蛋白，就很容易导致使用者发生呕吐、腹泻等症状，严重的甚至还会中毒。
除了劣质的胶原蛋白吃了会有副作用以外，一些优质的胶原蛋白有些人吃了也产生了一定的副作用。这是因为有些厂家可以为了让消费者服用胶原蛋白后的效果产生的更快更好，可能在加工过程中添加了一些激素或者制剂，这样的胶原蛋白就会在长期服用后产生一定的副作用，所以要补充胶原蛋白最好还是选择无添加的纯胶原蛋白。
