台湾地区解严后的历任领导人，对钓鱼岛主张各异，最极端的是李登辉，他竟然声称钓鱼岛属于日本；马英九是保钓运动大将，对主权维护最积极，任内议定《台日渔业协议》；陈水扁曾登彭佳屿宣示钓鱼岛主权，执政之初，派3艘军舰绕钓鱼岛海域；蔡英文则重申钓鱼岛主权。以4位领导人保钓作为而论，马英九时代，上下一心，终获签订台日渔业协定。里子面子兼顾，获最大进展。
李登辉
解严以来（1988年以后），4位领导人因出身背景与政党不同，加上须考量美日等外部环境影响，对钓鱼岛主权有不同主张与表现。李登辉在所著《余生》中说“钓鱼岛列屿不归属台湾”，引起朝野哗然。蒋经国在1988年骤逝，时任副领导人李登辉转正，当时台海空军活动局限于以钓鱼岛及与那国岛和台湾的“中线”以西，渔民在钓鱼岛附近作业时，不断受到日本政府驱赶。李登辉卸任后，2002年却明确主张钓鱼岛属于日本，他声称，历史上没有任何事实证明钓鱼岛属于中国，日本已长期实质占有钓鱼岛，主权属于日本是国际法的现实，最近中日又没战争，为何主权会变中国的？
陈水扁在2005年8月10日曾亲自带领媒体参访彭佳屿，并在岛上主持“海疆屏障”揭碑仪式，展现维护北方海域秩序决心，还重申钓鱼岛主权属于台湾。
陈水扁8年任内，钓鱼岛海域仅有零星争议，因此扁除了一贯宣示钓鱼岛主权以外，也主张依循国际法惯例，以沟通谈判解决争端，并主张渔权问题与主权争议应脱钩处理，他是“台美日价值同盟”战略观，台湾与日本已经维持多年友好关系，加入钓鱼岛主权争议将严重破坏台日关系，对台湾极为不利，因此陈水扁只向日本争取渔权共享。
台湾在60年代掀起保钓运动，马英九是重要成员。他在1986年于台湾政大法律研究所任教期间出版《从新海洋法，论钓鱼岛列屿与东海划界问题》，后来他在哈佛的博士论文《怒海油争：东海海床划界及外人投资之法律问题》，都谈钓鱼岛主权。马也和扁一样，到彭佳屿宣示主权，并就《东海和平倡议》发表政策谈话。2013年，台日签署渔业协议，钓鱼岛主权未让，资源共享，是其任内重大政绩。协议为解决钓鱼岛渔业纠纷，除重新划定台日渔民作业区域及双方执法权限外，为达到“主权不能让步，资源可以共享”原则，在协议中加入“免责条款”，确定双方落实协议的行为，不影响各自在海洋法问题的立场。
至于蔡英文，石垣市将钓鱼岛列屿更名为“登野城尖阁”，相对于大陆派出海警驱逐日本渔船，以及宜兰地方抗议的大动作，蔡英文回应一贯冷处理，仅由蔡办重申钓鱼岛列屿是“固有领土”，“在野党”与渔民盼蔡当局勿让“维护主权”沦为口头宣示。
综合台湾媒体报道
