一、影响网站访问
在进行网站运营以及SEO优化的过程当中，有不少因素之间会出现连锁的反应。在大陆地区，所有服务器上的网站域名必须备案，如果你的域名没有备案，那么你的服务器就不能够放在大陆，用户在访问你的网站时，打开速度会相对较慢，对用户的体验会很差。而搜索引擎处理网站排名的时候，会考虑到用户在网站的使用体验，因此产生连锁的反应，从而影响到了网站排名。在不断强调页面加载速度与客户体验的现在，这一点点的访问时间可能就决定了你的最终排名。
二、影响网站流量
随着搜索引擎算法的不断更新，地理位置也开始被纳入到算法当中。以百度搜索引擎为例，在前几年，百度在搜索关键词时出现的内容相差不多时不会因为地理位置的变化而变化;但是随着算法的更新改变，搜索引擎会根据部分关键词和不同地区用户的搜索习惯让不同地方搜索同个关键词的出现的结果不一样。就如第一条所说，如果网站没有进行备案，那么就不能够放在国内，那么在触及到地域方面的关键词时，该网站就没有了先天优势，也就使网站错失了部分流量。
三、国内容搜索引擎的站长工具都有对新站有备案号提交的优先权
百度已经官方声明过，未备案的域名，其网站在搜索引擎中的关键词排名不会受到影响，也就是说：从算法的角度分析，备案这个维度并不是排序的影响点。但是有一点，在新站保护的时候，百度站长工具会要求你提交备案号，你就少了新站保护的资格。
