中国与尼泊尔的国界基本上是沿着喜马拉雅山主脊。这里不仅有世界第一高峰——珠穆朗玛，也是世界上6000、7000、8000米以上雪山最集中的区域。大喜马拉雅山南坡是世界上地势最为陡峻的地方，来自印度洋的水汽形成了丰富的地形雨，由于水源丰沛、重力梯度集中，河流溯源侵蚀剧烈，从而切穿了大喜马拉雅山主脊，延伸到我国境内。
马甲藏布（孔雀河）以东还有吉隆藏布、波曲（麻章藏布）、绒辖藏布、朋曲等河恒河的支流，这些流域不连续的镶嵌在我国境内，每条河流都对应着大喜马拉雅山上的分水岭隘口，是沟通我国与南亚交通的重要孔道。其中朋曲流域面积约2.5万平方公里，河长376公里，是最主要的一条河流，流入尼泊尔后称阿润河，下游是尼泊尔东部著名的特兰平原，与支流孙科西河汇合后称戈西河，流入印度的恒河平原。
朋曲以东的康布曲、洛扎怒曲、达旺─娘江曲、卡门曲（鲍罗里河）、西巴霞曲、察隅河等河流都是自西藏流入印度境内，并先后汇入布拉马普特拉河，这些河流流域连成一片，是藏南诸河的主体。这些河流集中分布在大喜马拉雅山南坡，水利水电资源丰富，目前基本上尚未得到利用。
这些河谷是千百年来地壳上升和流水下切在地球的表皮上留下的历史的纹路，也是沟通喜马拉雅山两麓的孔道。当公路越过喜马拉雅山分水岭碍口，不期而遇的是陡崖绝壁和印度洋湿润的季风，层林尽绿、流泉飞瀑、村庄梯田、草甸花海、雪岭冰川，如同一幅斑斓的立体画卷扑面而来。由于季风带来的湿热空气，喜马拉雅山南麓有地球上最北的热带雨林，从山脚到山顶几乎浓缩了赤道到北极的自然带——热带雨林、亚热带常绿森林、温带针阔混交林、寒温带针叶林、高山草原、苔原、冻原以至冰川依次展开，点缀期间的是山麓平地上的零散的村庄，山脚下是水田橘林，山腰青稞绿，油菜黄，桃花盛开，更高的地方牦牛和山羊安静的在吃草。喜马拉雅山南麓降水充沛，海洋性冰川发育，与青藏高原腹地的大陆冰川相比，海洋冰川水分补给充沛、更活跃、移动更快，雪线更低，甚至可以突入山谷的丛林中。高山峡谷中的公路，往往都是在崖壁上凿出来的Z字形路线。然而，山脉北麓的雨影区则荒凉如月球或者火星表面。
亚东和聂木拉、吉隆也是日喀则镶嵌在喜马拉雅山南麓的三片绿洲，所不同的是亚东位于中印不丹三国的交汇处，通过乃堆拉山口与印度锡金邦接壤，而聂木拉（樟木）和吉隆对面是尼泊尔，是中尼边贸重要的口岸。亚东沟（或春丕峡谷）、樟木沟和吉隆沟也是是背包客传说中的（日喀则）喜马拉雅山南五条沟之三。亚东沟由绒布曲和麻曲两条河谷组成，两河在亚东县城（下司马镇）附近汇合后，称为绒布麻曲，流入不丹。樟木沟和吉隆沟分别是中尼公路东线和西线在国内的终点。五条沟中另外两条分别是定日县珠峰东西两侧的陈塘（朋曲峡谷，包括支流嘎玛沟，出境后为尼泊尔阿润河）和绒辖沟。
喜马拉雅山和伯舒拉岭分水岭南侧，墨脱和察隅是著齐名的“西藏江南”。北方的雪山阻挡了北方的寒冷，也使得印度洋和孟加拉湾的水汽在山脉迎风坡形成充沛的降水，充沛的降水带来了丰富的水热资源，使得热带雨林自然带向北跳跃了约10个纬度，喜马拉雅山脉南坡的雅鲁藏布江下游和察隅河流域，出现了世界上最北方的热带雨林和最壮观的垂直自然带。
但是极其陡峻的地形和大量降水，使深藏于雅鲁藏布大峡谷中的墨脱，成为我国最后一个通公路的县，几十年来从G318波密县扎木进出墨脱的简易公路几次通车，随即又为洪水、泥石流冲毁，在伯舒拉岭的大山里面留下了114K（里程数）这样类似于三十里铺的新地名。后来在雪线以下打通了嘎隆拉隧道，扎墨公路才勉强全年通车，但雨季也是时通时阻。路面和桥梁一不留神就被暴雨山洪冲到雅鲁藏布江里面了。
